▲为了镇压瑞典，丹麦在斯德哥尔摩发动大屠*，直接导致联盟崩塌
退出同盟后，瑞典在古斯塔夫二世的改革下，实行征兵制，又改进了兵器。经过多年的励精图治，瑞典的战斗力逐渐提高，成为了北欧另一个可以叫板丹麦的强国。从此丹麦和瑞典陷入了长达3个世纪的北欧霸权争夺之中。
▲1600年的丹麦，除了挪威部分外，还控制着斯堪的纳维亚半岛的南部地区
17世纪60年代，瑞典和丹麦之间爆发战争。经过军事改革而实力强劲的瑞典大败丹麦。瑞典为了获得厄勒海峡的控制权，与战败的丹麦签订和约，丹麦把斯堪的纳维亚半岛南部割让给瑞典。和约的签订使得厄勒海峡从丹麦的内海，变成了瑞典和丹麦共同拥有的海峡。
▲瑞典在1658年领土达到顶峰，丹麦除挪威的领土外，彻底退出了斯堪的纳维亚半岛
打败了昔日北欧霸主的瑞典，成为北欧新霸主，野心大涨。瑞典为了巩固对波罗的海地区的控制，1700年还与波兰、沙俄进行“大北方战争”。
不甘心丢掉斯堪的纳维亚半岛南部的丹麦也加入沙俄和波兰一方。最终，沙俄波兰联军大获全胜。战败的瑞典从此退出了北欧霸权的争夺。
但由于厄勒海峡重要的战略地位，包括沙俄在内的欧洲列强都不希望海峡被一个国家单独控制，因此列强没有同意丹麦收回斯堪的纳维亚南部的要求，丹麦的希望落空。最终，哥本哈根成为丹麦与瑞典边境的首都的格局彻底定型。
▲厄勒海峡成为丹麦和瑞典共有海域
既然哥本哈根与宿敌瑞典隔海相望，那丹麦为什么没有考虑迁都呢？这既有历史原因，也有现实的考虑。
在大北方战争中，瑞典对俄作战失败，在北欧的地位开始下降，不再好战，对丹麦的威胁有所减少。瑞典在1814年宣布成为中立国（1995年加入欧盟后放弃中立国地位）。在两次世界大战中，瑞典均保持中立，目前也没有加入任何的军事组织（如北约）。这些原因使得丹麦为防外敌入侵而迁都的必要性不足。
