BDNF是指脑源性神经营养因子，它是我们大脑的养料，它可以保护健康的脑细胞，修复衰竭的脑细胞，它与感情、记忆。睡眠等都有很大的关联。而抑郁症患者血液中BDNF水平往往低于正常值。经过重复经颅磁刺激治疗后，BDNF水平逐渐恢复正常，抑郁症状也就得到了改善。
rTMS对抑郁症的作用（1）可以改善抑郁症患者的思维、记忆
抑郁症患者会有认知减退，记忆力下降的症状，rTMS可以促进患者认知功能的改善，可以明显提高患者的记忆力和思维水平。
（2）可改善抑郁症患者的情绪和睡眠
抑郁症患者最显著的特征就是长期情绪低落，研究结果表明rTMS可以明显改善患者的抑郁情绪，绝望感没那么强烈了。并且对于有失眠困扰的患者还可以延长睡眠时间，减少中途醒来的次数，早上也不会醒那么早了。
（3）可以降低抑郁症患者自*的风险
使用rTMS治疗可以有效减轻患者的自*想法，联合药物治疗抑郁症可以快速起效。
重复经颅磁刺激最大的不良反应有可能引起癫痫发作，另外还可能会引起头痛、刺激部位损伤等。有文献结果表示，数千例应用重复经颅磁刺激进行治疗的病例，其中仅有一例抑郁症患者和6例正常人出现短暂的癫痫发作。另有rTMS治疗青少年自*、自残症状的临床试验证明，出现头痛的几率也比较小，还是相对来说比较安全的。
