由于前列腺素也与维持人体胃肠道和肾脏等的正常功能有关，因此有少数人应用双氯芬酸钠出现胃肠道受损。双氯芬酸钠对环氧酶-2的抑制明显高于对环氧酶-1的抑制，因此它引起的胃肠道不良反应少于阿司匹林、吲哚美辛等药物。双氯芬酸钠的抗炎、镇痛、解热作用比吲哚美辛强2~2.5倍，比阿司匹林强26~50倍。
在临床上，双氯芬酸钠可用于缓解风湿性关节炎、类风湿关节炎、骨性关节炎、强直性脊柱炎、痛风性关节炎等多种慢性关节炎的急性发作期或持续性的关节肿痛症状；用于非关节性的各种软组织风湿性疾病和疼痛，如肩痛、腱鞘炎、肌腱炎、滑囊炎、肌痛等；用于急性轻、中度疼痛，如腰背痛、扭伤、劳损及其他软组织损伤引起的疼痛，以及手术后疼痛、创伤后疼痛、痛经、头痛、牙痛等；可与抗感染药物合用，治疗耳鼻喉严重的感染性疼痛和炎症（如扁桃体炎、耳炎、鼻窦炎等）。
在安全性方面，胃肠道反应为双氯芬酸钠的主要不良反应。表现为胃肠道刺激症状，如恶心、呕吐、腹泻、上腹痛、便秘、胃不适、胃烧灼感、消化不良、纳差、反酸等，上述症状在停药后均可消失。少数患者可出现胃溃疡、十二指肠溃疡、胃黏膜出血、穿孔等。少见肝功能损害，可由此引起畏食、右上腹痛，亦可能仅出现肝酶一过性轻度或中度升高，个别患者出现可逆性黄疸。也有发生急性肝炎的报道。罕见肝功能紊乱。
此外，双氯芬酸钠偶见头痛、眩晕、嗜睡、失眠、兴奋等。偶可出现视力、听力障碍；偶有肾功能下降，可导致水钠潴留，表现为尿量减少、面部水肿、体质量骤增等，个别病例可出现急性肾功能不全、血尿、肾病综合征，另可见血清尿酸含量下降、尿中尿酸含量升高(因肾清除功能增强）；十分罕见粒细胞减少、血小板减少、溶血性贫血，个别病例可出现白细胞减少，也有导致骨髓抑制或使之加重的可能；可见一过性过敏性皮疹。严重的皮肤反应有多形渗出性红斑、中毒性表皮松解 ，均十分罕见。个别病例可出现脱发；极少数患者可出现心律不齐、耳鸣等；有发生全身性中毒反应伴脑炎的报道。
服用双氯芬酸钠需要注意：
- 双氯芬酸钠可能使严重心血管血栓形成事件、心肌梗死、脑卒中发生的风险增加（以上情况均可能致死)，这种风险可能随用药持续时间而增加。有心血管疾病或心血管疾病风险因素的患者风险更大。
- 双氯芬酸钠可能使严重胃肠道不良事件（包括胃或肠道出血、溃疡和穿孔）发生的风险增加（以上情况均可能致死)，这些事件可以发生在用药的任何时候，无警示症状。老年患者发生的风险更大。
- 肠溶片口服起效迅速但排出亦快，待急性疼痛控制后宜用缓释剂型，减少服药次数，维持稳定血药浓度。
- 肠溶剂型可减少对胃黏膜的刺激，而缓释剂型能较好地控制血药浓度，提高患者对药物的依从性。
- 不要空腹服用，用药期间不建议饮酒，不宜与抗凝药（如华法林）联用，可能增加出血风险。
- 足量使用1-2周无效后可再更改为另1种非甾体抗炎药，避免同时服用2种或2种以上非甾体抗炎药。
- 可导致血清肝酶一过性升高，血清尿酸含量下降，尿尿酸含量升高，可能会对诊断造成影响。
- 用药期间应常规随访检查肝、肾功能。
- 含有钠盐，对限制钠盐摄入量的患者应慎用。
- 可增加心血管事件风险，故服用剂量不宜过大，使用最低有效剂量，疗程不宜过长。
