在中国，同仁堂与胡庆余堂 ( 杭州 )、陈李济 ( 广州 )、叶开泰 ( 武 汉 ) 并称“四大药店”。后三家的地区归属比较好交代；谈到同仁堂， 人们则会感到有些麻烦，往往还要追问一句：您所说的是北京的 同仁堂，还是南京的同仁堂？——南京同仁堂在历史上本是北京 同仁堂的分号，现在不但已没有这种本店分店的关系，其本身更 已发展成为与北京同仁堂齐名、同样享誉海内外的生产中成药的 著名企业。
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说到南京同仁堂的缘起，便不能不谈到中国最著名的中成药 店——北京同仁堂。北京同仁堂 始创于清康熙八年 (1669 年 )，创 办人为乐尊育。乐氏原姓岳，浙 江绍兴人。
明末，乐尊育来到京城， 借住在大栅栏一家专门招待来往 药材商人的客栈里，做了个走街 串巷的郎中，并兼卖点药材。客栈的主人姓乐，山西人，渐渐就与岳尊育熟悉起来，乃至十分相得。
清初，乐氏夫妇返晋探亲，遂将客栈暂交岳尊育代管。不料自此 杏无音信，代管成了自管，岳氏乃将这家客栈正式继承下来，取 名“同仁堂”；同时为表对乐氏的感念，自改岳姓为乐。至于定 1669 年为正式建店的年代，乃是因为同仁堂于是年改行商为坐商、 兼带行医，经营内容和方式都发生了质的改变 ( 此说据北京市政 协文史资料研究委员会所编《驰名京华的老字号》，文史资料出 版社 1986 年版。关于北京同仁堂的缘起，还存在着另一种说法。
据南京同仁堂 1991 年所修厂志，乐氏原籍浙江宁波磁水镇，世 代以串铃走方行医为业，明永乐年间举家移居北京。1662 年即康 熙元年，乐尊育入清皇室太医院任吏目。利用职务之便广为搜集 各种药方，于 1669 年创办同仁堂药室 )。乐尊育知书好学，经商行医之外，常努力钻研医药典籍，同 时，广泛搜集古方、验方、宫廷秘方和各家祖传良方，并“辨药 味地道疑似，遵古炮制，竭力而不断更新”，制售的药剂无不配方独到、选料得当、工艺精湛、疗效显著，因此生意很是兴隆； 更重要的是，由于乐家一位远亲曾任清宫御药房领班，同仁堂在 发展过程中得到了官府的很大支持，到了咸丰年间，更独家承揽 起向御药房供药的美差，不但每年都可以预先领到承办宫廷药、 料的官银，资金较为充裕，乐氏家族还享有种种御赐特权。
从此， 同仁堂便发达起来，成为一家实力雄厚、享誉四方的中药名铺。 但乐家有一项极其严格的规定：同仁堂不设分号；族内各房虽然 以自开字号，但只能悬挂“乐家老铺”的匾额，而不许用“同仁堂” 三字。这项族规实行了二百多年，直至 1927 年国民政府定都南京， 乐家决定派乐笃周开设南京分号，才被打破。
乐笃周是乐家第十三代嫡孙，生于 1894 午 1 月，1912 年赴 法国勤工俭学，1918 年从巴黎商业管理学院毕业。他在同辈中排 第五，有“乐老五”之称；又因为在族内显得不够富裕而又颇多 主张，与家族其他成员亦有矛盾，曾被冠以“鸡爪子”的绰号。
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他是个识见极广的“新派”人物，留学期间曾游历英国、德国、 意大利、瑞典、瑞士等十数个国家，认真考察了西方诸国的医药 状况。1923 年学成回国后，曾应邀在张学良将军的北平 ( 京 ) 行 署任顾问，亦曾受蔡元培、李石曾、蒋梦麟及顾梦馀诸先生之邀， 任北京大学的讲师。
与此同时，他仍在北京同仁堂当职。当职期间， 笃周多次提出改进国药、革新国药，使之走上西药生产、研究道 路的建议；亦曾提出“大同仁主义”的主张，认为各房开设的店、 铺号应当全部归并管理，统一使用牌号，统一经营，统一药价， 然后再从所得盈余中提取部分基金，用于扩大族业、发展国药。 这些主张侵犯了各房的利益，因此遭到族人的奚落和坚决反对。
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国民政府定 都南京后，随着 政治中心的南移， 北京城的达官贵 人及市民相应减 少，同仁堂的业 务渐趋萧 条。有 鉴于 此，乐认为同仁堂应当在新国都有所发展，遂决定打破常规，派员赴宁开办分号。而所以选 中乐笃周，一方面是缘于其个人能力，另一方面也寓有缓和家族内部矛盾之意。
乐笃周来到南京后，经过认真考察，最后选定繁 华的中华路 31 号 ( 今 218 号 ) 及白下路 36 号面积共六百多平方 米的迎街门面房，并在中华路旧房基础上翻建一幢二层新楼，投资 4500 万元，筹办南京同仁堂。这 4500 万包括后来开办中央商场支店所投入的 1500 万元，都是由北京同仁堂乐氏“四大房”的 25 位*合股而出的，乐笃周被举荐为*代表。1929 年 5 月， 经国民政府社会局批准，“北京同仁堂京都乐家老铺南京分号”( 简 称南京同仁堂 ) 正式开业。
南京同仁堂与北京同仁堂之间是一种极其紧密的承继关系， 在最初的一段时间，它几乎就是北京同仁堂的翻版：一切资金、 器物概由北京同仁堂拨付，所有员工皆由北京同仁堂遣派，所 得盈余均交北京同仁堂支配。
1927 至 1929 年间，南京同仁堂的 三十余名员工即系从北京派来；1934 年，因业务扩大，又有二十 多名员工自北南来。这些人“子承父业，父承师教”，无不具有 娴熟的生产技能和丰富的经营管理经验。
南京店的经营方式也完 全承袭北京店的办法：总设管理处作为领导机构，其下设药房、 账房。药房管制药，下设蜡皮组、丸药组、配料组；账房管总体 财务，兼理私产。
同仁堂采用门市部与工厂分立的模式。工厂生 产同仁堂配方的各种中成药、饮片及参茸等药材，无论丸、散、 膏、丹、酒，均以工艺精良而著称。门市部则负责销售，下有前柜， 直接发货，每日需做详致的统计表，钱货自应吻合：有账房，其 下又有内外之分，前者管钱及开支，后者管货账及丸药细料；有 刀房，负责切药；有碾房，负责碾压药面；还有一个专门的参茸柜， 专营参茸细料；此外，设有一个专管送货的传达室。如此等等， 不一而足。均可见其分工之明确、管理之缜密。
同仁堂分配职工 工资也有别于旧时一般的企业，并不平均分配，而是采用固定工 资加“分零钱”的方式，当天营业额、当天结算、当天分配。所谓“分零钱”，即指营业额提成。由于南京同仁堂的所有员工都 是“非亲即故”或数代世袭在北京同仁堂工作过的，“分零钱”时， 先根据他们的工龄、岗位、实绩，按四厘至四分 ( 即 0．4％至 4％ ) 的比例，划出十几个档次进行分配，年底再将利润的 5％至 15％ ( 其 余须交北京总号 ) 进行一次总的分红。职工工龄满 10 年后去世， 其遗属还可以享受到一半的“零钱”标准，过一两年后再逐年递 减比例。
每日分得的零钱的多寡，与工作实绩关系殊大，干得好 的，提成就多；而冬季滋补药品畅销，夏天暑药好卖，自然就调 节了季节带来的淡、旺和“分零钱”的差距，到了每年年终，腊 月二十六日“扫房”后，乐氏家族的代表还要向全体员工致送数 额不等的“谢仪”( 红包 )。这些都是北京店的老办法。
南京同仁堂开业以后，不但迅速在万商云集的金陵古城站稳了 脚跟，业务范围更逐步扩展到了国内外。为适应这种形势，乐笃周 及时进行了机构上的调整，将中华路 31 号改为“南京同仁堂总号”， 其前店经营中成药、饮片及高档参茸滋补品、药材，后坊专门复制、 炮制、加工中成药及饮片；将白下路 36 号设为“南京同仁堂分号”， 负责生产膏、水、露、汀、酒剂，兼营饮片、汤剂，并附设代客煎 煮部。
1935 年底，又在由国民党中央委员张静江、曾养甫等人发起 建造的雄冠金陵的中央商场内，增设了“南京同仁堂支店”，经营 中成药、饮片、参茸滋补品及药材之类。这样，南京同仁堂就形成 了一个相对完整的生产、销售体系，并以其可靠的质量、周到的服务， 赢得了社会的广泛赞誉，一跃而成为华东地区医药行业中的巨擘。
1937 年，乐笃周又与兄弟合资，在上海开设了宏仁堂药店。但好景 不长，到年底，日本侵略军在南京进行疯狂的屠*，同仁堂也突罹大难，其大楼被烧得只剩下一副框架，员工惊惶四散，部分员工应 召去上海宏仁堂供职。次年，同仁堂营业生产大楼才在修整后复业， 原职工多数被召回。到了 1947 年，乐笃周又亲往台北考察，准备开 设南京同仁堂销售处。经过一番筹办，分销处于第二年在台北世界 书局内开张，南京店派出两位员工主持其事。不过，此时南京同仁 堂的日子并不好过，由于国民政府滥发金圆券以及对中药行业实行 “八·一五”限价政策，其经营受到很大冲击，昔日顾客摩肩接踵 的盛况已殊难寻觅了。
1949 年 4 月 23 日，南京获得了解放。而在此之前，鉴于国 民党政府政治、经济上的腐败不堪及军事上的节节败退，乐笃周 已深知时局必将发生重大变化，曾想远走台湾。他先将家眷、 二十余位员工及大批贵重药材带到台湾，然后回了南京。正当他 忙于收拾、准备彻底搬往台岛的时候，南京已经解放了。
从此， 乐笃周一人就留在了大陆，直至 1979 年 8 月 1 日他以 85 岁高龄 辞世，仍未能实现阖家团聚。乐笃周欲赴台岛，倒并不是因为他 对中国共产党怀有敌意；事实上，他在沪上掌管宏仁堂时，即曾 与中共党员管易文、杨慎初多有接触，受到了新民主主义思想的 影响，对中国共产党也有了一些了解。后来，南京同仁堂和上海 宏仁堂都曾作为新四军一部的秘密联络点，乐笃周不但亲自安排 联络员的吃住，还曾帮助送信、采购药品。
南京解放后，乐笃周 积极拥护中国共产党和人民政府的领导，而同仁堂和他本人也受 到党和政府的保护、扶持。新中国成立之后，公方代表即进驻该店， 得到了店方的积极合作。1950 年 8 月，乐笃周当选为上海市第一 届政协委员。1953 年，在“三反”“五反”运动后，南京同仁堂被评为基本守法户。
随着新政府对经济、社会的调整，到 1955 年， 南京市旧有的中成药生产、加工企业或裁撤或转向，只有同仁堂 保留了下来。是年 10 月 1 日，南京市政府正式宣布批准同仁堂 公私合营，定其名称为“公私合营南京同仁堂国药号股份有限公 司”，公方代表任经理，乐笃周任第—副经理；1956 年，其正式 名称又改为“南京同仁堂制药厂”，乐笃周改任南京中药股份有 限公司副经理。乐氏是南京市第三、四、五届人民代表，市政协 第四、五届委员，还是市工商联常务委员。他于 1963 年 9 月以 南京同仁堂*、南京市医药公司副经理身份退休，后定居上海， 继续参加统战、政协工作及一些有益的社会活动，直至 1979 年 8月 1 日因心脏病猝发，不治而逝。
南京同仁堂现位于雨花台西麓窑岗村 32 号，是 1969 年 10 月搬迁过来的。今日的同仁堂，虽然技术条件、工艺水平、生产 规模已远非昔日可比，但仍秉承着“炮制虽繁，必不敢省人工； 品味虽贵，必不敢减物力”的祖训，以解除患者病痛为己任，始 终致力于在祖传药典基础上博采民间验方，从中选出精粹，然后 用现代科技手段推出新品。
同仁堂非常注重将祖国传统医学与现 代科学有机结合起来，尤其是改革开放以来，网罗并重用了一大 批具有专门知识的各类高、中级人才，同时不断进行生产手段的 改进与完善，不但按 GMP 要求建起了生产大楼和冲剂、片剂、 丸剂、胶囊剂等生产线，实现了胶囊填装的半自动化，还采用了 全自动密丸机及喷雾干燥设备，引进了国际先进的高效液相检测 与双波长薄层扫描技术，使产品质量和生产效率进一步得到提高， 中成药的科技含量日见增加。1978 年以来，同仁堂制药厂的产值、利润均以年均 12—15％的速度递增，出口供货值亦成倍提高。
1998 年 11 月，南京同仁堂制药厂改名为南京同仁堂药业有限责 任公司，此举标志着这家著名的中华老字号的经营、管理又迈上 了一个新台阶。公司下辖供销公司、中成药研究所、同乐机械厂、 三个生产车间、南京保健滋补品厂及一个控股中外合资企业—— 同仁堂裕丰制药有限公司，并有六大药房；还准备利用“同仁堂” 的品牌优势，建立一家大型批发市场。今日的同仁堂，已成为全 国五十六家重点中药厂之一，同时也是南京惟—一家以现代科技 生产古方传统品种和综合新剂型，集科、工、贸于一体的大型中 药企业。
同仁堂的产品，现有 150 余个。其中有很多传统古方精粹， 如平肝、滋肾、明目的石斛夜光丸，补气血、清虚热的乌鸡白凤 丸，润肠通便的麻仁丸，以及大活络丸、牛黄清心丸、虎骨酒、 十全大补丸等，无不被医家视为药中珍品，成为国内众多大中型 医院处方的首选。
在重点生产传统产品的同时，还研制出了大批 具有首创意义的新产品，如专治泌尿系统结石的特效药排石冲剂， 抗结核的纯中药制剂优福宁胶囊，主治乳糜尿、乳糜血尿的水蜈 蚣冲剂，解决乳腺增生病气滞症的国家级新药乳宁颗粒，治疗妇 科血症的特效药血安胶囊，清肺定喘的国家级新药止咳化痰颗粒， 以及舒冠片、骨刺片等，一经面世便大受欢迎，并获得了国家、 省部级的奖励。为满足人们日益增长的保健滋补的需要，同仁堂 还兼顾保健滋补品的研究生产，推出了珍珠末等一批名品。古老 的“同仁堂”招牌不但没有被岁月的风尘所遮掩，反而放射出更 加夺目的光华。
