首先，二者性质不同。安史之乱实际上属于胡汉矛盾的产物。每当胡汉矛盾激化之时，中原汉民族往往强调夷夏大防。另外，安史之乱和五胡乱华的胡人本身多为贵族，他们与中原世族本就属于同一阶级。安禄山曾出仕唐朝多年，深谙中国政治文化。为了尽快建立起可行的统治，他积极寻求并且利用唐朝的官僚机构，借助门阀士族的力量从而巩固统治。而黄巢起义的性质是下层民众的暴动，属阶级斗争的范围。他们起义的目的就是为了推翻凌驾在他们之上的门阀士族。这时候，门阀士族就成为他们革命的对象。出于报复心理，黄巢在整整四年内都在各地大肆破坏，对唐朝世族发起了大规模的*戮。其次，安史之乱造成大量人数伤亡的地点多集中在北方地区（特别是河北藩镇区域）。这样，世族尚且可以通过迁移来躲避动乱。而黄巢起义以及随之而来的动乱，几乎影响了唐王朝境内所有人口多的地方，此时已经很少有足够安全的地方来给世族避难了。简言之，唐末最后的动乱，恰恰是集中于两京和周边地区，进而导致了世族大规模的消亡。
经过农民起义军的巨大冲击， 李唐王朝的统治基础动摇了。借而发迹的朱全忠势力崛起， 逐渐控制了李唐政权。天祐二年五月，朝中官僚世族，宰相裴枢（河东著姓）、崔远（博陵名族）等被贬逐，接着吏部尚书陆扆（吴姓世族）、工部尚书王溥（太原著姓）等也被贬。所以，黄巢起义对唐末世族产生了严重影响，彻底摧毁了门阀士族的势力。随后持续不断的政治暴力和战乱严重影响着唐王朝和整个社会。在这一时期，世族有的被灭门，有的家族离散飘零。即便他们当中有些人可以躲过一次或多次动乱，也失去了往日的辉煌，无法继续维持自身的影响力。
至此，由李渊父子构筑并绵延了一个半世纪之久的唐代门阀政治体系，土崩瓦解了。这不仅是唐代门阀政治的结束，而且是中国历史上自魏晋以来的门阀政治的结束。门阀政治结束以后，五代时期的士族还继续存在了一段时间，但不再形成集团，不再能操纵政府。随着北宋的建立，士族彻底衰落了。
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