菠萝蜜树主枝和侧枝修剪后示意图
第三年，还要将细弱枝，密集枝，过旺枝，下垂枝剪除。还有一种粗壮直立向上生长的霸王枝，这种枝条涨势很旺，会消耗大量的养分，严重影响树体的营养分配，这种枝条也必须剪除。
菠萝蜜树修剪后树形展示
定植后的第二年至第三年幼树要把好施肥关，在春季夏季各追施一次复合肥，第二年每株施氮磷钾比例为15：15：15的三元复合肥100克左右，第三年增加到每株施120克左右。在秋季还要施一次农家肥，施肥时肥料要逐层施入。先将杂草、树叶放在最底层，再施入农家有机肥，第二年与第三年都是每棵树施入5千克左右。农家有机肥的营养元素较全面，为开花挂果贮备营养打好基础，经过三年的精心培育，菠萝蜜的幼树初长成，笔直的树干，粗壮的枝条，油亮的叶片，准备跨入成年树时代。
第四年成年树的管理：如果管理得当，菠萝蜜第四年就是收获的时期了。嫁接后的马来西亚1号、马来西亚5号优良品种一年四季都是可以开花结果的。但有两个主要的开花结果期，第一次开花期是在2~3月，于6月前后采摘第一批果。第二次开花期是在7月前后，采收期是10~11月。菠萝蜜从开花到采收需要四个月左右的时间，因为它具有四季开花的特性，不集中的花果可以根据需要灵活的留花留果。
菠萝蜜开花结果期的关键管理措施：在每年的1~2月，施促花肥，开沟施入磷钾肥，施磷肥1千克，钾肥0.5千克，以促进花芽的形成，也有利于坐果。在有充足的肥料养分，充足的光照，树势生长良好的综合因素下，主枝和侧枝上的花芽很快萌发并抽出，到了2~3月菠萝蜜花序渐渐长成。菠萝蜜树只要营养充足，养分够，那么满树都是花芽，为了把有效地养分集中起来，让那些有效的花芽生长发育，千万不可以贪心，多余的花芽要把它疏掉。第一个是把主干（主枝下面部分）上的花芽统统疏掉，树的主干上是不留花序的。第二步要把生长枝（主枝 侧枝）上的过密的病害花序疏掉。
菠萝蜜花分为蜂和虫授粉，它们授粉成母粉，雄花序就会发黑枯萎，完成光荣的使命，雌花序就会长成果实，菠萝蜜花经过授粉坐果，到两个月后涨势良好，有的一棵树结几十个果，有的枝干上生长的果实有大有小。菠萝蜜坐果授粉率高挂果量多，在生产中要采取疏果来保果实的产量和质量。一般是果实有拳头大小开始疏果，果实要合理分布，一个枝留一个果就可以了。利于果实生长为原则，保留果形端正壮大，着生在主枝上的健壮果实。按树体留果，一般情况下投产的第一年，一棵树留1~2个，第2年留3~4个，随着树龄增大，树势旺盛，留果量逐渐递增。疏果要把不健康，发育不全的畸形果剪掉。菠萝蜜果堪称巨无霸，它们在果实发育期急需更多的养分，满足果实继续疯狂的生长，在4~5月，要及时施壮果肥，每株施钾肥1千克，利于果实糖分的积累，再施氮磷钾为15：15：15的三元复合肥2千克，促进果实膨大，提高品质。
