【三号机】的机体因为遭到使徒的侵蚀，所以最后被拟人模式操作的初号机掀开胸甲、压扁脑袋、扯断四肢、扯出能源提供装置后严重损毁（报废）。
【四号机】在性能方面基本与二号机相同，与三号机相反的是采用银白色涂装，动画中它并没有正式出场，因为在美国的S2机关搭载试验中，与NERV第二支部一块消失了，所以简单了解一下就行。
【五号机】全称为“局地限用型暂设五号机(EVA-05)”，性能与其他EVA机体有很大差别，右手是可拆卸的骑士长矛，左手可装配钳子代替EVA的双手，由于同步率的问题导致五号机的力量低于其他机型。
【六号机】是出现在《EVA新剧场版：破》里面的新机型，SEELE将其称之为“真正的EVA”，造型方面与初号机相近，头上有角状装置和光环，造型与初号机有少许接近，头上有角及光环，武器为最后出现的隆基努斯之枪的复制品“破”。
