套养泥鳅和普通养殖区别在于，要随着水芹和泥鳅的生长调节水位，控制水位在田埂下20厘米，并保证灌水时间和水芹管理相一致。
苏州地区，对水芹也改良了原来的深栽软化栽培的缺陷，改秋冬单茬的生产为全年多茬，这样水芹实现了整年的不间断供应，并且水芹产品也有了以叶柄和芹薹为主的多样性。每亩水芹全年总产量能达到1万到1.5万公斤，产值在3-4万元。再加上泥鳅创造的产值，每年总产值远超4万元。
水芹种植在浮动的浮排上，浮排的框架一般选用3厘米的PVC塑料管，在拐弯处，一定要用密封胶粘牢，防止水渗入管内，框架中间要用小竹竿或者毛竹片加固，扎好框架之后，用孔径2-3厘米的尼龙网，也就是渔网罩住整个框架，并在四周用尼龙线绑紧。这样就可以在水田上放筏了。
水芹品种，一般选择抗热和耐寒品种，例如苏芹12-5和苏芹16-1。虽然一年四季都能进行水芹的栽种，不过最好避开夏季炎热时候，并且秋季是水芹排种成活率最高的时候。水深一般选择25厘米左右，无根的种芹一般选在8-10月份排种，而带根的种芹就简单的多，只要避开酷暑和严寒，问题都不大。注意每组浮床要和田埂保留至少0.8米间距，这样既能有利于投放泥鳅的饵料，也有利于施肥，更让水芹之间有通风和透气的可能，增加水中氧气含量，泥鳅方便活动和长个。待水芹长成之后，还方便水芹的收割。
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