林鹤年以一种“先锋”的姿态致力于中国台湾的开发，除了建铁路，他更是从欧美购买先进的机器，帮助台湾岛兴修水利，并且开发金矿。然而，大施拳脚却因一场战争而终止。1895年甲午战争爆发，林鹤年积极投入抗敌斗争中，但形势已成定局，于是林鹤年全家撤回福建，定居在鼓浪屿。
时逢乱世，林鹤年也只有先安顿下来，再图报国。于是，他在鼓浪屿修建了怡园。在修建怡园过程中，林鹤年偶得道光年间厦门书法家吕世宜“小桃源”石刻一块，欣喜中林鹤年以“桃源”为谶，暗自欢喜“小桃源”与怡园之意相吻合，于是便作诗道：
“
心清何地不桃源，鸡犬桑麻任笑喧。
”
然而，乱世哪有桃源居，在岛上生活一段时间后，林鹤年不禁感叹，鼓浪屿弹丸小岛华洋杂居，卧榻之旁外人酣睡，这让他不禁感慨“已无净土”，也“悔作桃源避”。
林鹤年在厦期间，倡导创办东亚书院，地方上发展轮船、矿务、报馆等事务，也大都因其倡导和促使而办成。
怡园有这“三宝”
“一宝”：“国姓井”
传说当年官兵奉命挖井，掘地皆见顽石；郑成功巡营至此，挥剑泉出，因称“剑泉”。又称“国姓井”。
“二宝”：太湖石桌椅
