粪肠球菌在生长繁殖过程中还会产生维生素、氨基酸、促生长因子等多种营养物质，促进铁、钙、锌等矿物元素的吸收，补充机体营养元素；此外，粪肠球菌可使饲料中的纤维变软，提高饲料的转化率。肠球菌能够提高动物的免疫力，增强其抗病原菌感染能力。
粪肠球菌在动物肠道可形成生物薄膜附着于动物肠道粘膜上，并且发育、生长和繁殖，形成乳酸菌屏障，抵御外来病菌病毒及霉菌毒素等有害物质侵袭，具有免疫屏障功效。
粪肠球菌制备成微生物制剂可直接投喂养殖动物，有利于改善肠道内微生态平衡，防治动物肠道菌丛区系紊乱。 分解蛋白质为小肽、合成B族维生素等功效。粪肠球菌也能增强巨噬细胞的活性，促进动物的免疫反应，提高抗体水平。粪肠球菌在动物肠道内可形成生物薄膜附着于动物肠道粘膜上，并且发育、生长和繁殖，可形成乳酸菌屏障，抵御外来病菌病毒及霉菌毒素等的副影响，而芽孢杆菌和酵母菌等都是过路菌，没有这个功能。
粪肠球菌能把部分蛋白质分解成酰胺和氨基酸，把大部分的碳水化合物的无氮浸出物转化为L型乳酸，可以对钙质合成L-乳酸钙，促进养殖动物对钙质的吸收。粪肠球菌还能够将饲料中的纤维变软，提高饲料的转化率。粪肠球菌粪肠球菌能够产生多种抗菌物质，这些抗菌物质对动物体内常见的致病菌具有良好的抑制作用。
