▲太湖的港汊岛屿众多，匪患数百年来从未断绝
据统计，当时太湖区域内有大小不等的土匪二百多股，大约五千多人。苏州吴江县的匪情最为严重，一度无法建立乡政府，对周边地区的人民财产安全构成很大威胁。
1949年4月23日至28日，南京、常州、苏州、湖州相继解放。到5月底，杭州和上海也已解放，长三角的战事基本平息，太湖剿匪被提上了日程。
▲解放初期，苏南苏北的差异很大，分别设立行署区予以管理
作为新解放区，江苏省对苏南、苏北及南京采取不同的管理模式，建立了一套临时性的行政体系，在5月初设立苏南行署区承担省职能，下辖松江、镇江、苏州和常州四个专区，专区的管辖范围接近明清的“府”。
行署区驻所在新成立的无锡市，该市从无锡县城及周边分拆出来，并由行署区直管，拥有太湖北岸的一部分管辖权。
而无锡县得以保留，仍然属于常州专区（后改属苏州专区）建制。
▲近代无锡工业发达，对太湖的航运价值开发程度较高
7月，苏南行署区组建太湖剿匪指挥部，苏州、常州、无锡三地配合太湖剿匪指挥部工作没有太大问题，但南太湖是浙江省湖州的管辖范围，给剿匪工作带来一定的困难。
太湖匪患自古屡禁不绝的重要原因之一，即是由于太湖分属不同州县管理。剿匪能否成功的关键并不在于军力多寡，而是情报和反应速度，太湖分治的现状恰恰制约着这两大因素。
▲苏北行署区、苏南行署区、南京市在1953年并入江苏省
浙江湖州的南太湖地区得到土匪行踪的情报后，首先要上报给当地政府，然后通知苏南行署区，最后交给太湖剿匪指挥部。
这时再出动剿匪部队已经延误不少时间，土匪很有可能利用这个空隙逃跑。
针对这个弊端，苏南行署区与浙江省进行协调，由苏南行署区主抓剿匪工作。一来大部分太湖水域本就位于江苏省境内，二来浙江省更关注沿海岛屿，对南太湖相对不太在意。
