什么叫alk融合,alk突变和alk融合怎么区分

首页 > 经验 > 作者:YD1662022-11-18 06:35:56

通讯作者:吴一龙

“ALK学院”借助线上资源,搭建学术交流平台,旨在汇聚肺癌ALK靶向学术内容,提高医生对ALK靶向治疗规范性的认识,精进诊疗水平。本期“ALK学院”精选6篇中国专家文献,每日一文以飨读者!

ALK融合基因作为继NSCLC EGFR突变后又一被发现的新型驱动基因,携带ALK融合基因的个体会获益于ALK TKI治疗,而不同患者对ALK TKI治疗的反应和持续时间差异很大。本研究是吴一龙团队开展的大样本中国肺癌人群分析,旨在探讨中国肺癌患者ALK重排与临床特征之间的关系以及阐述ALK融合基因的序列复杂性,相关研究结果于2017年发表在Lung Cancer杂志。

什么叫alk融合,alk突变和alk融合怎么区分(1)

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吴一龙教授、博士生导师

肿瘤学教授,博士生导师,IASLC杰出科学奖获得者

广东省人民医院(GGH)终身主任

广东省肺癌研究所(GLCI)名誉所长

广东省肺癌转化医学重点实验室主任

吴阶平基金会肿瘤医学部会长

中国临床肿瘤学会(CSCO)前任理事长

中国医师协会精准医学专委会副主任委员

广东省临床试验协会(GACT)会长

中国胸部肿瘤协作组(CTONG)主席

国际肺癌研究会(IASLC)理事会(BOD)核心成员,国际分期委员会前委员

欧洲肿瘤学会(ESMO)中国区总代表

背景:

在间变性大细胞淋巴瘤中,间变性淋巴瘤激酶 (anaplastic lymphoma kinase, ALK) 基因重排首次被证实可以与核仁磷酸蛋白 (nucleophosmin, NPM1) 发生融合。ALK融合基因被定义为继非小细胞肺癌 (non-small cell lung cancer, NSCLC) 表皮生长因子受体 (epidermal growth factor receptor, EGFR) 突变后又一被发现的新型驱动基因,通常携带ALK融合基因的个体会受益于ALK酪氨酸激酶抑制剂 (tyrosine kinase inhibitors, TKI) 治疗。然而,不同患者对ALK TKI治疗所产生的反应和持续时间差异很大。因此,亟需研究能够阐述导致上述反应异质性的潜在机制。

目前而言,ALK基因的融合伴侣差异很大,包括棘皮动物微管相关蛋白样4 (echinoderm microtubule-associated protein-like 4, EML4),驱动蛋白家族成员5B (kinesin family member 5B, KIF5B) 以及驱动蛋白轻链1 (kinesin light chain, KLC1) 等。EML4基因是ALK融合阳性肺癌患者的主要5'伴侣,并且EML4基因内的染色体断裂点经常发生在不同位点。然而,ALK基因内的断点相对来说更为保守,主要发生在19内含子或20外显子。相比于EGFR L858R患者,EGFR 19缺失患者可以从EGFR TKIs治疗获取更长的无进展生存期。此外,EGFR 19缺失患者在接受一线afatinib治疗后,可以获得更长的总生存期获益。这一现象激发我们去探究中国肺癌患者ALK变体类型的复杂性。

方法:

本研究为一项前瞻性研究,在2011年1月至2013年2月期间,共有1474例肺癌患者(95.5%为汉族,0.5%为少数民族) 入组。其中,1387例为NSCLC,54例为小细胞肺癌 (small cell lung cancer, SCLC),33例为原发部位为宫颈、乳腺和甲状腺的恶性肿瘤伴有肺转移。所有标本均获自广东省肺癌研究所 (Guangdong Lung Cancer Institute, GLCI) 生物样本库,并获得伦理委员会批准。NSCLC患者的主要组织学亚型如表1表示。

什么叫alk融合,alk突变和alk融合怎么区分(3)

表1

本研究的实验流程如图1所示,通过标准逆转录聚合酶反应 (reverse transcription polymerase chain Reaction, RT-PCR) 和cDNA末端快速扩增技术 (rapid amplification of cDNA ends, RACE)-偶联PCR并测序,对所有样品进行ALK重排测定。分析ALK融合和所有变异类型的发生频率,并在NSCLC中对其临床特征进行评估。此外,研究还对15例ALK阳性变异类型进行了分子克隆,用于序列复杂性分析。

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