此时,机长刘建平立刻回到驾驶舱,断开自动驾驶仪,手动操纵飞机。他在收回缝翼的同时,试图进行改出操作。他的操作导致飞机进入剧烈的俯仰角振荡,接下来的13秒内在机头向上和向下之间连续三次反复。
副驾驶这时发现了飞机的异常之处,其襟翼手柄为启动状态,于是他立刻收起了前缘缝翼,但这一举动又再次让飞机陷入了最猛烈的一次俯冲,俯角达到了向下24.3度。经过这一系列振荡,飞机下坠了约5千英尺的高度,速度也骤增至364节,触发了超速警报。
几秒内五千英尺的严重失重,使得乘务长就是够不到近在咫尺的广播器;客舱内没系安全带的乘客全部被抛向空中,被天花板砸伤头部;系了安全带的乘客眼看着被没系安全带的乘客砸在自己身上。
下午6时20分左右,高度降至2万8千英尺左右时,飞机的俯仰角在机长操控下渐趋稳定,逐渐恢复至向上5到8度之间缓慢爬升高度。缝翼误放94秒后,机长重新打开自动驾驶仪。飞机在自动驾驶仪操纵下再次爬至3万3千英尺。