寺院内的建筑依山势而建，沿山势层层递高，现有大雄宝殿、观音楼、韦驮殿、志公墓、藏经楼、念佛堂、药师佛塔、胭脂井、豁蒙楼、景阳楼等主要建筑。大雄宝殿内奉祀三宝佛，外山门、三大士阁、钟鼓楼、禅房、素菜馆等。山门牌坊“鸡鸣寺”由著名书法家、前中国协会长赵朴初所题。
鸡鸣寺1958年改为尼众道场。鸡鸣寺的观音菩萨与众不同。其他寺庙的观音都是坐北朝南，鸡鸣寺的观音像却是坐南朝北。为啥观音要倒坐？菩萨面前的对联一语道破：问大士为何倒坐，叹众生不肯回头。观音大士不忍看众生之苦，让大家蓦然回首觅知音。
“我劝你上鸡鸣寺去，最好选一个微雨天或月夜。”朱自清在《南京》里，头一个写的就是鸡鸣寺。有很多的著名人物与鸡鸣寺的历史故事或传说有关，如，“菩萨皇帝”梁武帝与同泰寺的渊源，达摩与同泰寺的密切关系，朱元璋敕建鸡鸣寺的史实，康熙、乾隆二帝与鸡鸣寺的关系，赵朴初与鸡鸣寺密切关系等等。
隐于闹市，落于山林，文人游览雅集，首选豁蒙楼”，豁蒙楼是时任两江总督张之洞为纪念其门生“戊戌六君子”之一杨锐修建的，"豁蒙"一词源自杜甫诗中的"忧来豁蒙蔽"句。豁蒙楼是鸡鸣寺的最高点，登临此处，凭栏望去，重峦叠嶂，烟岚缥缈，紫金山色、玄武水光尽收眼底，适宜泡一壶茶小坐，畅发心神，豁然开朗。张之洞题：“胜地何常经浩劫，斯楼不朽奈名传”。
鸡鸣寺活在古今文人墨客的诗词书画里，胡适吟诗鸡鸣寺的豁蒙楼：“豁蒙楼上同坐；月在钟山顶上，照见我们三个。我们吹了烛光，放进月光满地；我们说话不多，只觉得许多诗意。”作为新文化领袖的他春风正得意时，楼里也充满了诗意。郭沫若曾着大褂到鸡鸣寺求签题词，徐悲鸿笔下画出美丽多姿的鸡鸣寺，现在鸡鸣寺对面还有一个徐悲鸿画院。梁启超题：“江山重叠争供眼，风雨纵横乱入楼”。余光中、星云大师也曾来拜谒过鸡鸣寺。所有这些，一时是说不完的。你只有来过，看过，听过，品过，深呼吸过，才能感受到那股人文的气息、文化的味道。
鸡鸣寺的香火极为旺盛。据载，远在江宁方山的百姓都会到到鸡鸣寺来进香许愿，甚至有条河就叫进香河。听生活在南京的朋友说：自己的姻缘就是来这里求得来的，可想而知，这里承载了多少人对于姻缘、功名、学业的渴望。在豁蒙楼东的景阳楼，有一副有趣的对联：“鸡笼山下，帝子台城，振起景阳楼故址；玄武湖边，胭脂古井，依然同泰寺旧观。”这副对联包含着关于鸡笼山、台城、玄武湖、同泰寺和胭脂古井等遗迹的故事。
