为了减小损失，人们想出了不少方法来驱赶夜鹭。先是最原始的用人力驱赶并在鱼塘周围放置稻草人。但是第一次效果驱赶还可以，但是当夜鹭发现并不会对自己的生命构成威胁时，它们又会飞回来。
而且夜鹭多为夜晚才出来活动，而人类是夜晚休息，这夜鹭的作息完全和人类相反，导致鱼塘主也很难将夜鹭驱赶。
后来人们也想过别的方法，如放鞭炮或者用喇叭播放噪声来驱赶夜鹭，但同样也是只有前几次有用，等夜鹭适应了也就不再害怕了。而且这种方法还会影响到周围的邻居。
可见鱼塘主们为了保护自己的鱼不被夜鹭吃掉，可算是绞尽脑汁地与夜鹭斗智斗勇。
夜鹭数量过多除了会使鱼类受到威胁以外，夜鹭的粪便也会给人们造成麻烦。夜鹭与其他鸟类不同的地方是它的粪便常常伴有腐蚀性的特点。由于夜鹭特别能吃所以夜鹭成群栖息的树下，夜鹭的粪便常常堆积如山。
但夜鹭粪便的腐蚀性常常会把树下草地的草全部枯死，如果这棵树下长期堆满夜鹭粪便，那么这棵树甚至都有可能枯死。
河南郑州曾有两棵粗壮的法国梧桐树枯死，后经相关部门的人员调查发现，这两棵树的枯死可能与树上栖息的大量夜鹭有关系。
夜鹭的鸟粪中含有大量的碱性物质和盐类物质，会导致树木根部出现富营养化的现象。而且大量的鸟粪覆盖树叶，会妨碍树叶进行光合作用，日积月累的影响树木生长，直至树木无法再从外界获取生长所需的能量，所以导致树木的枯死。
