《三生三世枕上书》这个名字并不贴切。光听剧名，很多观众以为白凤九和东华帝君仅经历三世虐恋，实际上并非。
白凤九和东华帝君经历了四世虐恋，第一世是白凤九和东华帝君，两人本是无缘，世世不能相见。可天命随着东华无意中救了白凤九开始改变，衍生出另外三世。
被东华拯救后，凤九开始单相思，为了更靠近东华顺便报恩，她隐藏了青丘帝姬的身份，伪装成宫娥，进入太晨宫。谁知燕池悟误以为东华帝君要与其抢夺姬横公主，遂一直要与其单挑。
（东华帝君以下简称帝君）
燕池悟和帝君大战导致锁魂玉丢失，帝君不慎掉入十恶莲花镜，凤九为救帝君甘愿被聂初寅拿走九尾狐，成为普通狐狸。也正是这只普通狐狸和帝君展开一段隐秘的“恋情”。为何隐秘，因此时白凤九知帝君，深爱帝君，并被帝君伤到心，可帝君却只当她是宠物爱护着。最终，白凤九心灰意冷地回到青丘，此为第二世。
第三世是发生在人间，宋玄仁与小九。帝君受伤，调养身体恢复修为的最好的方式是到人间历劫，白凤九想救宋玄仁却无意改变了他的情劫。为了让宋玄仁成功历劫，白凤九成为他的宠妃历帮助他助情劫。这段爱情是情劫，是要宋玄仁爱而不得而死，凤九亦心灰意冷。明明两人相爱却不能在一起，此乃虐恋呀。
第一世还未结局，第二世第三世两人结局凄惨，第四世也是大家最感兴趣，却一直搞不明白的阿兰若和沉晔的故事，且听我慢慢道来。
天上有个天命石记载了神仙的姻缘，如开头第一世所说，东华帝君和白凤九无缘，凤九一片痴心必得藏冰雪，一腔艰辛合该付东流。因此，第二世，第三世两人都是有缘无份，甚至帝君和白凤九终未见一面。
缘分天命从何时开始改变？正是从阿兰若和沉晔出现开始。
01阿兰若和沉晔的前生；在第三世，帝君因调伏妙义慧明镜而沉睡，为六界不因此事发生动荡，于是假意对凡人的七情六欲有所兴致，要前往参详才去凡间历劫。帝君沉睡去凡间，重霖却担心缈落业再生祸端，于是与擅长造魂魄的耘庄仙伯商量，将帝君的一半影子造成一个魂魄投入梵音谷。影子生成魂魄不知自己乃帝君的影子，却能够震慑住缈落。梵音股的比翼鸟一族寿命短，只要该魂魄最终死去，就会重新成为帝君的影子，如此以来，帝君下凡一世才会顺利安心的进行。
于是耘庄仙伯便将帝君的影子投射成一个魂魄，来到梵音谷，成为沉晔。
幽冥司的冥主谢孤栦掌管着轮回台，此事被他无意得知，他与凤九是好友，知凤九一直想要报恩，遂将此事告知凤九。当时，凤九在天界刚刚伤心回来，对帝君的无情十分难过，却总觉得恩还没有报，亦或者说心中执念还未放下。心想今后估计无缘报恩，如果帝君只是下界为一个影子，面对着影子报恩总比对着真人报恩来的好。
于是便叫谢孤栦也将自己的影子拿拿去，做成魂魄，投生到他所在之处，即阿兰若出生的原因。阿兰若出生便带着使命，这个使命就是对沉晔报恩，只要沉晔有危险就去救他，他想要什么，就都帮他拿到。阿兰若的出生便是为沉晔而来，注定一生为他。
阿兰若沉晔的故事发生在帝君下凡前三十年。帝君影子下界，白凤九影子依旧跟随下界，此等痴心执着感动上苍，让天命石发生了一个小变动。这个变动就是沉晔和阿兰若将在梵音谷中有一对姻缘，不料苏陌叶无意中出现救了阿兰若出蛇谷，却改变了这个天命姻缘。
阿兰若和沉晔本该有缘，最终却无缘，实乃悲伤之事。也正因两人无缘再次让天命石改变些许，最终促成了帝君和白凤九的有缘。如果阿兰若和沉晔两人在一起了，也就没有帝君和白凤九后来的故事。因两人未在一起，天命师将这对姻缘补到了白凤九和帝君身上，才有了后来两人之相见，否则两人应该是生生世世无缘见面的命运。
02阿兰若和沉晔的今生故事；阿兰若和沉晔的故事很复杂。从剧情可知，阿兰若死去，沉晔为她造了一个阿兰若之梦，企图想要让阿兰若复生。白凤九为了得到频婆果，和帝君无意中进入这个世界，开始慢慢了解阿兰若和沉晔的故事。
沉晔降生时，是相里殷割腕放血所救，遂成为神官长继承人。周岁开始，沉晔便跟着神官长息泽学习，虽说有母亲，沉晔自小却就感觉到命运的无常与不由己，内心十分孤独。
直到10岁时，沉晔再次入宫，得知阿兰若出世。橘诺当时还小，对阿兰若也是有爱，告知沉晔妹妹呆萌可爱，沉晔便对妹妹饶有兴趣。得知妹妹被丢在蛇窝之中成长十分担心，于是独自前往，刚好碰到月圆守护蛇不在，妹妹饿的大哭。
沉晔便在解忧泉旁以血救了妹妹一命，并照顾妹妹，为她取名阿兰若，教她微笑，教她吃野果而不食老鼠。
