1.3亿年前的燕山运动，使得庐山在隆起之时，其东南侧出现大面积沉陷，形成了一个地堑型湖盆，这为鄱阳湖的形成奠定了基本的地质条件。
距今6000年左右，古长江在出湖北武穴后，在今江西省北侧形成了一个类似扇形三角洲的分汊水系，《禹贡》谓之“九江”，而这九江便汇注于——古彭蠡泽。
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古彭蠡泽为江水所汇，其范围相当于今长江北岸鄂东、皖西的滨江诸湖地带。以后，鄱阳湖周边地区开始沉陷，湖水逐渐南侵。隋朝时，彭蠡泽的湖面向南扩展至今鄱阳县城附近。
西汉时期的“彭蠡泽”▼
在唐末五代至北宋初期，新彭蠡泽迅速向东南方平原扩展，奠定了鄱阳湖今天的范围和形态。
而大运河开通后，鄱阳湖则成了关系江西水运与贸易通道的生死关节。明朝以来，大运河—长江—鄱阳湖—赣江—大庾岭—珠江（北江）—广州的水运交通干线更是成为中国古代中后期最重要的内陆南北水运大通道。
京广大水道示意图▼
13-16世纪，全球地质板块活动活跃，由于地震频发等因素，鄱阳湖东南面下沉趋势明显。而加之清代以来，我国气候处于小冰期，导致南方梅雨偏多，因此汇入鄱阳湖的地表径流持续增加，鄱阳湖进一步扩张，进入水域面积达6000平方公里的全盛时期。
从水文特征来看，鄱阳湖是一个典型的通江吞吐型湖泊，所谓“吞”是指鄱阳湖除了容纳修水、赣江、抚河、信江和饶河等河流的水流外，其在长江的吞江位置可能还会导致其“吞入”长江的部分径流；所谓“吐”是指其融汇的诸多河流都将经由鄱阳湖“吐”入长江。
鄱阳湖巨大的吞吐量
是导致其不同季节“判若两湖”的主要原因
（图：google map）▼
