1、单干整枝法
所谓单干整枝法，简单的来说就是只保留一个开花结果的主干（留1个生长头），具体来说就是在保留番茄主*前提下，把其他所有的侧枝侧蔓陆续性的全部疏除掉；此种整枝方式比较适合无限生长型番茄品种，种植密度较大、结果成熟期较早、生长期较短的番茄品种。
一般来说，单干整枝的番茄在留足5-7穗果的时候要及时进行打顶摘心（打头），打顶摘心时要注意在最后一穗果的上方选留2-3片用来制造养分的功能叶，在第1层花穗果实成熟采收后，可以根据番茄时机长势情况选择性的把第1层果实下部的老黄叶片摘除掉。
2、双杆整枝法
所谓双杆整枝法，简单来说就是保留2个开花结果枝蔓，在主干长势强壮的情况下，可以保留主干和另外从第一花序下方选留一个强壮枝做开花结果枝（双干），然后把其他所有的侧枝侧蔓陆续疏除掉，如果主干长势比较细弱，也可以在苗期把主干进行摘心或疏除，另外选两个长势健壮的侧枝作主干培养形成开花结果的双干；此种整枝方式比较适合有限生长型的番茄品种、生长期比较长的番茄品种、结果期比较晚的番茄品种、成熟期中晚的番茄品种，对于那些土壤肥力不足、种植密度较稀的番茄地块，也可以采用这种双杆整枝法。
3、连续单干整枝法
所谓连续单干整枝法，简单的来说就是对番茄的单干延伸枝进行连续整枝，具体操作方法是：在把第1花穗下方第1个侧枝及下方所有侧枝进行全部疏除的基础上，保留和选用番茄植株封顶最上方的侧枝代替主干继续向上生长，在选留的这个侧枝有长到封顶时，再从这个侧枝上选留封顶最上方侧芽代替侧枝继续向上生长，此后就按照这种方法反复操作，一直整理到番茄植株长到我们所需要的高度或留足我们所需要的花穗数为止。
连续单干整枝法，能够全面融合单干整枝和双杆整枝的优势，还可以避免单干整枝或双杆整枝模式上所存在的不足，既能保持番茄长势健壮，又能确保番茄有一个较高的产量，比较适合果型比较大的番茄品种使用。
在使用连续单干整枝法时，在番茄长到第3花穗开花时进行，在第3花穗坐果后、第4花穗开花后，此时可以选留2片健壮功能叶进行打顶摘心来培养第2基本枝，在第4花穗坐果且幼果开始膨大后，应当对第3花穗的基本进行扭枝，并把第3花序下方的侧枝选作第5花穗和第6花穗的着生枝进行培养，此时当第一花穗的果实已经充分长大后，应当及时把第1基本枝和第2基本枝间的叶片全部摘除掉，以此来改善番茄的通风采光条件。选留第5花穗下方的侧枝做第7花穗和第8花穗的着生枝，同时要适时把第2基本枝和第3基本枝间的叶片摘除掉，此后以此类推操作，知道番茄植株高度达到1.6-1.7左右、植株上留足5个基本枝、每隔基本枝上有2个花穗、整棵植株上有12-16个花穗位置。
对于自封顶的番茄品种来说，建议在过密的侧枝侧芽长到7-8公分时进行摘除掉，既不可让侧枝肆意生长，也不可让侧枝生长过密，否则会影响根系和植株的生长。
