施治时间是针灸处方的重要因素，在好的时间治疗对的病还能遇到合适的人，这些不是运气，而要事在人为，针治时间主要包括选择适宜的治疗时间、掌握好留针施灸时间、制定疗程时间和间歇时间、预测总体治疗时间等几个方面。
针灸疗效的取得，与时间因素也有密切关系。由于人体生理活动随着年月、时辰、季节、气候的不同而有着规律性的变化，许多疾病的发生和发展也有一定的时间性，因此，针灸治疗的效应也必然受到时间因素的影响。把握最佳的治疗时机，是提高临床疗效的重要环节。所谓治疗时机，有多方面的含义，早在《黄帝内经》中就有所反映的“治未病”和早期治疗的思想，就深刻地体现了这个道理。例如急性腰扭伤、落枕、面神经麻痹、中风后遗症等应及时治疗以较少的腧穴和疗次获取最快、最好的治疗效果。有些病证还要择时施治，即“察岁时于天道”，做到“春夏秋冬，各有所刺”，能够更好地发挥治疗作用，提高疗效。例如失眠症，上午治疗就不如下午或晚间治疗效果好，尤其是睡前1～2小时为最佳。有些周期性发作的病证，例如疟疾、癫痫、月经不调、痛经等，一定要在发作前施术，疗效才好。《素问·刺疟》说：“凡治疟，先发如食顷乃可以治，过之则失时也。”实践证明，针灸治疗疟疾的最佳时间是在规律性发作前2小时左右；癫痫应在发作前5～7天开始针刺；月经不调和痛经则应该在月经来潮之前3～5天开始治疗，直到月经干净为止；女子不孕最好能在排卵期前后连续针灸；神经性呕吐须在饭前施治，胆石症要在饭后治疗，头针疗法用于脑中风后遗症须待病情稳定（出血停止、血压稳定、神志清醒）后行针刺治疗为妥。有实验表明，在注射热原物质前连续针刺有关腧穴3天，或者在注射后立即针刺，其结果抑制发热的效应十分明显；如果等体温已经升高后再行针刺，则抑制发热的效应就不明显。子午流注和灵龟八法更具体地把取穴与时辰因素结合起来，集中地反映了古代“时间治疗学”的理念。
留针时间也是针灸处方中的重要内容。一般病证以留针20～30分钟为宜。对于不容易配合针刺操作的婴幼儿以及肢体痉挛性疾病的患者，不适合留针，可略施行针手法后旋即出针，防止发生弯针、断针事故。但对于一些急性痛证例如急性阑尾炎、急性胆绞痛、急性肾绞痛等则需要长久留针，少则1～2小时，多则10小时以上。
（三）疗程时间多数疾病如面瘫、风湿痹痛等，以针灸10次左右为1个疗程。部分急性或简单的病证，例如急性扭伤、牙痛、目赤肿痛等，以3～5次为1个疗程，少数慢性病、疑难病和运动功能障碍性疾病，例如肥胖症、男性不育、女子不孕、中风偏瘫、截瘫等，至少1个月为1个疗程。
《灵枢·经脉》说：“凡刺寒热者，皆多血络，必间日而一取之。”《灵枢·逆顺肥瘦》指出：“婴儿者，其肉脆，血少气弱，刺此者，浅刺而疾发针，日再可也。”《灵枢·寿夭刚柔》记载：“形先病而未入脏者，刺之半其日；脏先病者而形乃应者，刺之倍其日。”均说明有的病（人）针刺时间短，有的病（人）治疗时间长，有的2日针1次，有的则1日针2次。一般慢性病证，可每日或隔日治疗1次。但对于一些需要尽早控制的疾病，例如急性传染病、剧烈疼痛等，则需要每日2次或每隔5～6小时针灸1次，不可间隔太长时间，否则不利于积累疗效。每个疗程之间应休息3～5天，然后再继续下一个疗程。如此可以避免因连续刺激后机体产生的耐针性，使兴奋性降低而影响疗效。针灸间隔时间，有时还需要根据不同针灸方法而定。例如埋针疗法、埋线疗法、针挑疗法和刺络出血较多者，可1周左右治疗1次。施行瘢痕灸法者，其间隔时间也应适当延长。
患者大约需要治疗多长时间，也是处方时需要考虑的问题，应该有一个大概的估计。大致说来，凡急性、简单的病证，例如昏厥、急性扭伤、落枕、牙痛等，治疗时间较短，少则1次，多则3～5次即获痊愈。而慢性病、疑难病和肢体功能障碍性疾病，例如肥胖症、男性不育、女子不孕、中风偏瘫、截瘫等，治疗时间较长，少则数月，多则数年。有些疾病，在已经治愈后为了巩固疗效，防止复发，也还需要续治3～5次。但对于左右经络失衡引起的病证，例如面瘫、中风偏瘫、足内翻或足外翻等，经过治疗一旦达到了相对平衡，就应该收效即止，“已静勿动”。切不可贪效而多加治疗，以免“矫枉过正”，导致新的左右经络失衡。对于极少数疑难奇症的治疗，如果一时难以作出判断，不妨先试治5～10次，以观后效，再作出预测。
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