只有一小部分微生物能够在海草根际区茁壮成长，研究显示，这些微生物不仅能够消化蔗糖和降解酚类物质，还与海草存在着共生关系，能为海草提供生长所需的氮等营养物质。
这些海草草甸下的糖分仅有一小部分被消耗，是一个好消息，因为海草草甸下到糖分固定着碳，如果被微生物消耗光了，这些碳就将以二氧化碳的形式被释放到大气中。
尽管海草草甸在全球碳循环、海洋生态环境中发挥着重要作用，但受沿海开发、气候变化等影响，海草草甸的面积正在减少。当海草消失，失去酚类化合物的保护，海草根际层中的蔗糖将被微生物完全分解，其中蕴含的碳将被释放到大气中，总量估计可达15.4亿吨，这大约相当于3亿辆汽车一年所排放的二氧化碳量。
四、海草正面临的威胁
全球海草覆盖率正以每年 1.5% 的速度消失。这相当于每小时损失大约 2 个足球场的海草。据估计，在过去的一个世纪里，29% 的海草草地已经死亡。
海草容易受到物理干扰，例如风浪和风暴。然而，近几十年来，人类活动的直接和间接影响造成了海草床的大部分损失。例如来自肥料和污染的营养物质，会从土地上冲刷到水中，导致藻类大量繁殖，从而阻挡海草生长所必需的阳光。从农业和土地开发中冲入水中的沉积物也会通过窒息海草和阻挡阳光来破坏海草床。而船锚和螺旋桨则会*死部分海草并破坏栖息地。海草床的这种破碎会增加边缘周围的侵蚀，并影响海草床内的动物使用和运动。
温暖的海水温度也会损害海草。温度影响酶和新陈代谢的工作方式，也影响生物体的生长方式。温度升高还会增加海草对光的需求，影响海草在环境中吸收营养的速度，并使海草更容易生病。
鱼类的减少也会破坏食物网的重要组成部分，从而导致海草死亡。当大型捕食者被移除时，中间捕食者会变得更加丰富，它们反过来会导致保持海草叶片清洁的较小生物的衰退。
五、保护和修复海草床
目前，国际上高度重视海草床的保护与系统研究，一些发达国家相继实施了全球性或区域性研究计划，如美国的Seagrass Net计划、澳大利亚的Seagrass Watch计划等。中国与西方在治理理念和方法上有所不同。西方发达国家更加注重海草床生态功能的挖掘和资源保护，在修复方法上通常以量取胜。中国更注重海草床的修复，在技术上更加看重效果，修复规模的上升速度非常快。中国在该领域的优势主要是建立了比较完整的技术链条，从供体采集、苗种扩繁和人工培育、种子播种和植株移植、维护管理等方面形成了比较成熟的技术。
六、保护海草，让我们行动起来
1、不乱扔垃圾，做好垃圾分类
2、减少塑料垃圾，减少塑料制品的使用，并且关注塑料用品回收项目，坚决抵制使用一次性塑料制品，减少塑料垃圾排放到海洋中。
3、限制使用的化肥和*虫剂的数量、不要将任何有害物质倒入下水道
4、保护海洋生物，学习保育知识，了解海产食品，以支持其可持续发展。
5、保护海滩环境，积极参与海滩清洁、海洋无垃圾的活动。
6、选用生态环保产品，坚决抵制海洋生物制品；选用环保型防晒等。
7、支持海洋保护的组织，捐赠或者参与志愿者活动，这是我们能为海洋保护做得最直接的事
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