水产养殖业近几年来发展迅速，为了维持养殖业的绿色发展，越来越多的微生态制剂产品应用到水产养殖中。但是由于人们在使用过程中的一些不恰当的方式，大大影响了微生态制剂使用的有效性。本文从养殖操作中常见的几个因素着手，根据微生物的特性采用正确的使用方法，以发挥微生态制剂的最佳效果。
1、溶解氧
水体溶解氧的高低，会影响到好氧菌生长速率和氧化分解污染物的效率。目前微生物制剂中芽孢杆菌为好氧菌(或兼性)，硝化细菌为严格好氧菌，使用含有这类活菌的产品，一定要保持水体足够的溶氧，才能维持细菌快速繁殖和对污染物的有效分解。
2、碱度-pH值和盐度
碱度的大小表征 水体缓冲能力的大小。在藻类光合作用下，低碱度水体(CaC0 含量
3、营养缺乏或过多
细菌进入水体后繁殖速度与水体的营养水平有很大的关系。一般认为细菌生长对水体C、N、P的利用率100：5：1。如果水体太瘦，或营养成分单一或失衡，有些以养菌为主的活菌制剂不会大量繁殖，使用活菌几乎无效，此时应向水体中适当补充缺乏的营养才能达到更好的效果。
4、其他环境因素
若水体中吞噬细菌的轮虫，枝角类等浮游动物大量存在时使用会影响使用效果。另外水中重金属或农药等化学物质含量过高都会对微生物制剂使用效果产生影响。
1、浓度的用量
养殖的过程中要采用适量的剂量浓度，经相关实验研究表明，当枯草芽孢杆菌的浓度含量超过1000mg/kg时，可能因为菌体好氧气以及培养基在水体中的氧化作用会导致鱼缺氧而死。故作为水质改良剂的微生态制剂可根据养殖水体环境具体情况以7天作为时间周期全池泼洒一次，使用后及时开增氧机，这样可以使其作用效果更加明显。
2、使用的时间和间隔时间
芽孢杆菌属于需要氧气芽孢菌中的非致病菌，也是水产养殖行业应用最为广泛的益生菌。芽孢杆菌完成一代繁殖发育的时间很短，正常情况下仅需几分钟。水产领域广泛应用的枯草杆菌微生态制剂，在适宜的水体环境中繁殖一代也仅仅需要几十分钟。一般在使用微生态制剂的4～5天才开始起作用，一周左右的效果最佳。从开始水产养殖的时期，每隔10～15天使用一次。到养殖后期，水质发生变化，水中代谢废物含量会增加，此时需要加大使用量，使用间隔应该为3～5天一次。
3、使用禁忌
微生态制剂禁止与化学药品、消毒剂、抗生素同时使用。因为这些药物会大大影响微生态制剂的有效性和安全性。因此在施用微生态制剂后的生长周期内，最好不要使用化学药物，也不要更换水。如果因实际情况的需要，不得不使用，应该在换水或者是使用消毒剂5～7天后，重新按照原配浓度向养殖水体中投入等量的等浓度的微生态制剂。在存放的过程中，微生态制剂有发霉现象或是出现特殊味道要立即停用。微生态制剂的产品应该在开封后尽快使用，常温保存于干燥、凉暗处，用后要拧紧，密封。
