逢蒙手持利剑闯入后羿的内宅，威胁嫦娥交出仙药。嫦娥自知要是反抗，无异于以卵击石。为了不让丈夫辛苦求来的仙药落入坏人之手，情急之下，她一口吞下仙药。
只见嫦娥轻盈地飘离地面，从窗口飞出去，向着远处的天空飞去，越飞越高、越飞越远。嫦娥惦念家中的丈夫，便飞到离人间最近的月宫停留，从此成为月宫仙子，也称嫦娥仙子。
话说之前后裔除六害、射掉九个太阳，闻名天下。四海之内的英雄志士慕名而来，纷纷投师于后裔门下，一心跟他学艺。鱼目混珠的逢蒙，本是个小人，他混杂在众多弟子中，以学艺之名，隐藏其中。狡兔三窟，狡猾的逢蒙，左右逢源，一直未被人发现他的真面目。直到他想偷取神药才彻底暴露出来。
傍晚时分，后羿带着猎物满载而归。却发现妻子不见了，家中侍女哭成一团。他询问原委，才知道是小人逢蒙导致妻子消失。后羿大怒，拿剑去*这个恶徒，不料逢蒙已经逃走了。
再说月中之嫦娥，她日夜思念丈夫，怅然若失，悔之晚矣。她一心想要重返人间，于是催促吴刚快些砍伐桂树，督促玉兔快点到捣药，她千方百计想要配制仙药，可以重回人间。
“羿闻娥奔月而去，痛不欲生。月母感念其诚，允娥于月圆之日与羿会于月桂之下。民间有闻其窃窃私语者众焉”。
后裔得知妻子嫦娥已经奔月而去，再也不可能回到人间，伤心不已，悲痛欲绝。他日夜思念妻子，茶饭不思，彻夜失眠。有一天晚上，他无法入睡，在庭院中漫步，发现今晚的月色分外皎洁明亮，他仿佛看到妻子嫦娥的身影在月中晃动。难道嫦娥发现他了么？
为了寄托对妻子的思念，后羿让侍女在后花园摆好香案，放上嫦娥平时爱吃的水果点心之类，遥望月宫，祭拜妻子。月亮女神常羲看到后裔的所作所为，感念他心诚，于是特地准许嫦娥每年中秋月圆之夜，与丈夫后裔在月桂树之下相会。
据说，中秋夜的月亮特别圆，特别亮，那是为后裔照明，让他平安地与嫦娥相聚。民间传说，夜深时，遥望夜空，可以看到月宫中的身影，似乎可以听到他们在窃窃私语。
后来，百姓都知道了嫦娥奔月成仙的消息，大家都很想念善良的嫦娥，怀念多年来对大家的无私帮助。后羿除掉六大凶兽，射*九个太阳，成为百姓心中的英雄。他们夫妻二人，在百姓中有很高的威望。于是，每年的中秋夜，民间百姓自发设好香案，摆放各种水果、月饼。中秋拜月的习俗一直延续至今。
民间传说的版本，与两汉时期记载的版本略有不同。民间传说里，嫦娥到了月宫以后，孤独寂寞，万分后悔。李商隐在诗中所写，嫦娥应悔偷灵药，碧海青天夜夜心，反映的正是她的真实内心感受。
嫦娥思念丈夫后羿，她找机会跟他倾诉离情，告诉他，明日月圆时分，便是他们夫妻二人重聚之时。嫦娥嘱咐后羿，将面粉加水，做成月亮一样的圆形，放在他们家正屋的西北方向，然后呼唤嫦娥的名字，一直呼唤，到三更时分，她便能在声音的指引下飞回家。到了第二天晚上，后羿按照嫦娥的吩咐去做，果然见到妻子从月中缓缓飞来，夫妻团聚。
