既然有毛囊干细胞，那也决定了毛囊也有着生命周期，所有毛囊的生命周期，都可分为生长期、衰退期以及休止期。
所谓的生长期就是毛囊生长最活跃的时期，这一期间毛囊处于正常工作状态，毛发也一直健康的生长，正常健康的成人头皮上，大约有90%-95%的毛囊都处于生长期 ，此期可持续2-8年，这时最大的“幸福”烦恼就是感觉刚理发没几天头发又变长了。
而过了生长期，头发的毛囊就会迎来2-3周的衰退期，在这个时期，毛囊里的细胞也开始程序性凋亡，毛发不会再变长，同时发根还会从皮下组织被推挤到毛囊干细胞的附近，毛囊也由长变短，体积缩小，这时的头发就不如以前坚挺了，用手稍微用点力就会拔下来，可以看见发根连带的发囊没有正常的那种透亮的样子，而是变得短且萎缩。
短暂的衰退期一过，毛囊细胞凋亡的差不多了，毛囊便进入了长达2-3个月的休止期。这时，头发与毛囊的连接将不再紧密，可以说是已经“死了”，随时有脱落的危机。而且，因为黑色素生成下降，我们还可以看到发根渐变成白色的。
但对于毛囊这种周期性组织而言，死亡也意味着重生。在成熟哺乳动物中，毛囊是唯一具有自我再生的结构。当一个毛囊完成一个生长周期之后，只会稍作休息，便在各种激素、化学物质以及生长因子等共同调控刺激下进入下一轮的生长期。重生的毛囊会再生出一根新的头发，以前死亡的头发会自然脱落，将由新长出毛发接替上岗。
那如果毛囊里没有重生怎么办？也不要担心，每天自然脱落的头发大约有100根，相应地也会重生100个毛囊，在理想状态下，我们的头发数量会稳定地保持在10万根-15万根左右的，如果大范围的毛囊死亡，比如秃顶，那就得找其他原因了。
同理，其他哺乳类动物的毛囊也有着类似的生长周期，只是周期长与短的问题。人类头皮的毛囊生长期能到2-8年，这在自然界是非常例外中的例外了，甚至人体其他部位的毛发也没这么长的生长期。
对于其他哺乳动物而言，比如猩猩和猴子们，因为周期非常短，它的毛还没长到特别长时就已经掉落了。最好的例子还是我们身边的宠物猫狗，它们的毛发是根据季节来变换的，特定的毛发在特定的季节发挥作用，所以毛孩子们“一年掉两次，一次掉半年”的调侃正是这么来的。
