赤潮给山东省渤海沿岸市县对虾养殖和海洋捕捞造成巨大损失。东营市11万亩虾池，平均单产仅47千克，比1988年平均单产63.4千克减少16.4千克，比根据虾池前期长势预计的单产减少30千克。
东营市广饶县水产养殖开发公司2000多亩虾池对虾死亡1/3。利津县养殖公司自9月上旬开始，虾病明显增多，当时中产池单产也有65千克，而10月出池时高产池每亩只有45千克，虾体很瘦，呈现病态。1989年6月，青岛海洋大学王克行副教授在东营市水域调查发现，简单裸甲藻、蓝绿裸甲藻密度达20万个/毫升，育苗室160万个/毫升，表明黄河口附近水域严重富营养化。惠民地区沿海自8月下旬始，赤潮持续1个多月。沾化县7.16万亩虾池，直接受害的约5.3万亩，亩产由前3年平均单产45千克降为18.5千克，其中接近绝产的2.1万亩，单产仅有7千克，全县因此减产1550吨，经济损失2488万元。潍坊市沿海两县一区18万亩虾池前期长势喜人，后期因受赤潮危害对虾发生浮头和多种病症，由此减产近3000吨。莱州市1989年养殖对虾减产840吨，扇贝减产640吨，海洋捕捞减产5000吨，共造成经济损失2500多万元。
赤潮给捕捞业也造成巨大损失。以海捕对虾为例，1989年渤海增殖放流虾苗22亿尾，同时采取强化管理措施，护送亲虾进湾。按正常年景这两项措施可保证湾内对虾总量在1.5万~2万吨。8月上旬，科研部门预报的产量也在这个范围内。但该年实际捕捞量只有3500吨，不足高产年份4万吨的1/10,成为历史最低年份。定置渔具的毛虾也比上年减产数千吨。莱州湾滩涂的贝类也因赤潮大批死亡。
综上所述，这场灾害所造成的损失在国内是首次，在国外也属罕见，仅山东省渤海沿岸的渔业损失就达上亿元。
二、赤潮的成因赤潮形成的主要原因是陆源大量工业废水和生活污水等长期超标入海。
