目前，南京港是长三角唯一实现集装箱铁路与水路无缝对接的港口，国家实施12.5米深水航道延伸至南京工程，使南京一跃成为最深入内陆的国际型深水海港，变成长江中上游最直接、最快捷的出海口，也是中国连结全球的江海转运综合枢纽。
今年5月，长江南京以下12.5米深水航道二期工程已正式试运行，南京至长江出海口431公里的12.5米深水航道全线贯通。这意味着5万吨级海轮可直达南京，10万吨级海轮可减载抵达南京，20万吨级海轮可减载乘潮到达江阴……
如今的南京港，已成为中国华东地区及长江流域江海换装、水陆中转、货物集散和对外开放的多功能江海型港口。南京港立足华东地区和长江流域、面向世界，成为现代化、多功能的江海型主枢纽港；并与上海国际航运中心协同发展，成为中国国家长江航运中心和国家现代物流中心。
太仓港——集装箱第一大港
深水航道从南京港也延续到了太仓港，打通了深水航道长江最末端的“血管”。太仓港地处长江和沿海开放交汇处，拥有38.8公里长江岸线，以及－12.5米深水航道，是江苏仅有、中国难得、世界少见的天然良港。
