在《流感》中，主角必然是“不完美”的普通人。因一场意外事故，身为消防救援队员的男主姜智久（张赫饰），对传染科医生的女主金仁海心生爱恋，这种感情上的执念，成为这部影片剧情走向最重要的支撑。女主金仁海（秀爱饰），是一名疾病专家外，还是一位单亲妈妈，带着在情感上比她还机灵的女儿美日，和男主的大无畏相比，女主的行为即透露着“母爱的自私”，在得知女儿被感染后，隐瞒病情并且偷偷治疗，一切都以女儿的生命为大，但谁的母亲又不会这样做的呢？只有女儿活下去，才是她最大的心愿。不过，作为一个单亲妈妈，金仁海的自私、冷漠、势利，以及对女儿心怀愧疚的爱，也让整个剧情走向变得复杂、危险起来。明知传染风险的医生女主，不仅隐瞒了女儿被感染的真相，还不顾一切的想尽办法救女儿；明知女主女儿会让更多人传染，男主还是故意冒名顶替。
如果说，致命病毒是夺走人们生命元凶，那么，人性的阴暗面才是造成人祸的根源。片尾，充满良知的韩国总统，在关键时刻的强硬立场，阻止了一场无可避免的流血冲突；女医生的女儿因拥有抗病毒的血清，而成为解救所有感染者的“英雄”。这是一个看来皆大欢喜的结局。
