1、通风：想要更好的保存荞麦，需要保证足够的空气流通，让荞麦粉有空气呼吸可利用。
2、湿度干爽：荞麦会随着保存的环境湿度及温度而改变自身的湿度，如果环境湿度比较大，那么荞麦粉所含的水分就会增加，很容易出现结块的现象。如果所处的环境湿度比较小，那么荞麦的含水量也会相对减少，据研究表明荞麦的保存湿度维持在60%-70%之间最佳。
3、温度合适：储存荞麦的温度会直接影响面粉的熟成度，温度越高的话熟成的也越快，而且也决定了荞麦的保存时间，一般建议保存在18-24摄氏度最佳。
4、保存环境：保存荞麦的环境应洁净，这样能更好的减少害虫的滋生，预防一些微生物的繁殖，从而能减少荞麦受污染的几率。
5、定期清洁：保证存放荞麦的地方没有异味，定期清洁，进一步的降低荞麦受污染的机会
在荞麦收获后，含水率较高，应降至13%以下。储藏中应注意：
(1)雨、露、水湿芥麦籽粒的处理。雨、露、水湿芥麦籽呼吸作用较强，粒附着的微生物亦多，容易发热和霉变。遭到雨淋、含水率在以上的养麦籽粒，在气温较高的夏季，即使袋装单批堆放，经常通风，也会变质。为保管好雨湿荞麦籽粒，最好进行晾晒或烘干。烘晒和烘干不仅能降低水分，同时还能*菌。
(2)发热的处理。发现荞麦籽粒温度失常后，不论是因后熟作用或含水率高所引起，均应立即处理，以减轻变质或避免变质。处理方法最好是晒干或烘干。如无条件及时晾晒或烘干，应立即摊晾，降低麦温，散失水分。
(3)霉变的处理。荞麦霉变后，品质降低，气味变劣。极少量霉变荞麦籽粒混入正常荞麦中，能使全部荞麦的加工产品带有异味。所以，霉变后的荞麦，即使为数不多，亦应立即进行晾晒或烘干，单独存放，另作处理。绝不能混入正常荞麦中，因小害大。
(4)仓虫的防治。防治仓虫的发生和繁殖，与清理仓房、杜绝虫源有关。荞麦含水量与仓虫滋生关系甚密。防止荞麦生虫，最好是收后晾晒彻底，防仓虫发生。荞麦生虫后，夏季“晒热入仓”、冬季低温冷冻*虫也有效果。在条件许可地区，可用熏蒸剂*虫。
