康熙二十八年（1689年）
康熙帝第二次南巡，查验河工，祭大禹陵，再次拜谒明孝陵；颁行《孝经衍义》 册立佟国维之女贵妃佟氏为皇后，次日皇后驾崩，谥号孝懿仁皇后；派索额图与沙俄谈判，签订《中俄尼布楚条约》确定中俄东段边界。
康熙二十九年（1690年）
下诏修三朝国史，《大清会典》修成；康熙第一次亲征噶尔丹，命裕亲王福全为抚远大将军，皇长子胤禔为副将，恭亲王常宁为安远大将军；噶尔丹大败乌兰布通，清军获胜。
康熙三十年（1691年）
翻译《通鉴纲目》完成；蒙古喀尔喀部归附，康熙帝北巡，举行多伦会盟，设置蒙古旗制管理。
康熙三十一年（1692年）
在玉泉山举行阅兵；下旨改玉泉山澄心园为静明园，召科尔沁亲王沙津入京，面授机宜，诱使噶尔丹深入。
康熙三十二年（1693年）
准噶尔策旺阿拉布坦遣使入贡，向康熙报告使臣马迪被害及噶尔丹情报；同年，康熙下旨维修盛京，皇十五子允禑（xú）出生。
康熙三十三年（1694年）
下旨撰修《渊鉴类函》，设立虎枪营；康熙亲临巡视京畿河堤；在丰泽园亲试翰林出身官员。 康熙帝下令求贤，徐元学、王鸿绪、高士奇等人受到提拔；同年，温僖贵妃钮祜禄氏去世。
康熙三十四年（1695年）
下旨重建太和殿；并再次巡视京畿河工及海口运道，建海神庙；同年在南苑举行阅兵，皇十六子胤禄出生。
康熙三十五年（1696年）
康熙帝下诏再次亲征噶尔丹，于西苑蕉园设内监官学，令太监读书，命皇太子胤礽监国；抚远大将军董鄂·费扬古大败噶尔丹于昭莫多，斩其妻阿奴，噶尔丹再次遣使投降；同年，皇十一子胤禌去世。
康熙三十六年（1697年）
康熙帝第三次亲征噶尔丹，命皇太子胤礽监国，不久噶尔丹战败服毒自*，漠北平定；下旨令宗室及满洲诸生参加乡试、会试，同年皇六女和硕恪靖公主下嫁喀尔喀郡王敦布多尔济，皇十七子胤礼出生。
康熙三十七年（1698年）
康熙帝第三次巡幸五台山，命皇长子允禔、大学士伊桑阿祭金太祖、金世宗陵；封皇长子胤禔为直郡王、皇三子胤祉为诚郡王，皇四子胤禛、皇五子胤祺、皇七子胤祐、皇八子胤禩俱为贝勒；赐名永定河，建河神庙；奉皇太后东巡塞外。
康熙三十八年（1699年）
康熙帝第三次南巡启銮，巡视黄河大堤，在江宁举行阅兵，诚郡王胤祉母亲去世，因其不及百日剃发，被降为贝勒；再次视察永定河工程，令直郡王胤禔率领八旗将士协助修永定河堤；同年发生顺天乡试舞弊案。
康熙三十九年（1700年）
康熙亲视永定河工程，并指示修河方略；皇太后六十万寿节；同年再次巡阅永定河。
康熙四十年（1701年）
应河道总督张鹏翮奏请，加封金龙四大王；允准御史张瑗奏请，派人毁魏忠贤墓；同年，皇十八子胤衸出生。
康熙四十一年（1702年）
第四次巡幸五台山；下旨建造国子监、维修大禹陵；康熙帝第四次南巡行至德州时，皇太子胤礽生病，中途回銮； 同年，皇十九子胤禝出生。
康熙四十二年（1703年）
适逢康熙五十岁万寿节，加恩赏赐百官；索额图挑唆皇太子胤礽自立，被康熙称为“天下第一罪人”，拘禁于宗人府；同年，康熙再次巡幸塞外，并西巡山陕诸省。
康熙四十三年（1704年）
下旨封淮河神为长源佑顺大淮之神，派遣侍卫拉锡察视黄河河源；赐四品典仪凌柱女钮祜禄氏为皇四子胤禛格格；并下旨撰修《佩文韵府》 。
康熙四十四年（1705年）
《古文渊鉴》撰成；康熙帝第五次南巡阅河，命选江南、浙江举、贡、生、监善书者入京修书；同年，江宁织造曹寅校刊《全唐诗》书成；国子监落成，康熙帝与罗马教廷发生冲突，下令禁教。
康熙四十五年（1706年）
康熙帝北巡塞外，在热河建避暑山庄，作为每年秋狝驻跸行宫，下旨修《功臣传》。 五世达赖喇嘛圆寂，其属下第巴桑结嘉措隐匿十六年不报，迫于局势，康熙只好默认六世达赖喇嘛仓央嘉措；同年，皇二十子胤祎出生。
康熙四十六年（1707年 ）
康熙帝第六次南巡；北巡塞外，巡幸诸蒙古部落。
