华佗类似行医的事迹，在史料中比比皆是。有趣的是，历史上的名医，都会有诸多"神迹"的记载，这似乎意味着，很多事迹本身可能仅仅是穿凿附会。
因为科学技术有限，彼时人们并不知道疾病发作时身体的确切情况，所以相关的治疗过程就被传得神乎其神。就这样，华佗在东汉末年的名气越来越大，而且最终被曹操所得知。
和曹操之间的恩怨纠葛曹操是个多疑的人，或许正因为思虑太多，导致患上了严重的头风病。事实上，常年的军旅生涯，再加上事无巨细的劳作，身体上积累一点顽疾并不奇怪。
中年之后，曹操时常被头风病所困，发作起来哭爹喊娘，或许还要随手*掉身边的几个人才能罢休。由于身边没什么良医，因此曹操很是苦恼。
直到有人举荐华佗，曹操将信将疑：神医？而且还跟自己是同乡？我怎么从来没听说过这人，该不会是个徒有其名的骗子吧？身边的人看曹操犹豫，瞅准时机再次推荐，先试试再说嘛，最终曹操答应了。
于是在一次发作期间，众人簇拥着把华佗请来了。一旁的医生急得束手无策，华佗不紧不慢，汤药和针灸齐上阵，才将曹操从发作的痛苦中拯救了过来。曹操缓过劲儿来，才知道是华佗救的自己。至此，曹操知道华佗有真本事，于是，特封华佗为侍医。
华佗心有不快，但当着曹操的面又不敢发作。彼时，医生本身就不是一个固定的职业，地位低下已经让华佗心有所忌，但在医生的前面再加上一个侍，这让华佗心理更是不爽。华佗一番思量之后，决定跟曹操请假回家。曹操居然答应了，不过要求华佗尽快回来。
然而华佗回去之后就没打算归程，曹操干等了一段时间发现华佗不来，心里很是生气。华佗回家的借口是妻子病了，曹操就派人去看看，要是真病了就送点礼物，要是没病，就立刻把华佗给抓来。
最终，华佗被抓到了许昌的监狱，曹操下令严刑拷问。到底拷问一个医生什么，或许曹操自己都不知道。由于彼时华佗的医术高明名气大，荀彧最终都站出来给华佗求情。但正在气头上的曹操却不松口，还说什么天底下这样的鼠辈多到无数，死华佗一个不算什么。就这样，华佗死在了曹操的大狱中。
华佗究竟是个什么样的人后世都觉得曹操*华佗太仓促而且理由不足，于是文学演绎中，就安排了华佗试图刺*曹操的桥段，这样看起来逻辑似乎将说得通了。
而且在《三国演义》中，还提到了华佗根除曹操疾病的说法。华佗说曹操的病能够根除，但需要做手术。要将曹操的头颅劈开，把头风取出来，病也就彻底好了。谁知道曹操听闻就害怕了，认为华佗这么做是要害自己，所以就把他下大狱了。
《演义》是给曹操*华佗添加了一个合适的理由，由于曹操多疑的个性，华佗的这种治疗方法在当时惊世骇俗，所以从逻辑上看，曹操有疑心是很正常的。可实际情况，并没有那么复杂。
曹操自始至终没有将华佗放在一个平等的面看待，无论是曹操当时的身份，还是彼时的社会氛围，曹操都不会对一个白身的医生正眼相待。
而对华佗来说，年轻的时候或许真想自由奔放，随着年纪的增大，还是会逐渐向当时的世俗观念靠拢。因此，华佗被曹操留在身边，或许还想着能借助这份力量，在官宦道路上获得一份真正的机会。
而华佗的心思则被曹操看破，华佗几次三番地推脱，似乎被曹操看成了讨价还价，最终给自己招致*身之祸。于是，《后汉书》才有对华佗"为人性恶，难得意，且耻以医见业"的评价。
