巴西龟是杂食性动物，可以吃各种食物，食物的多样性很重要，多样性的食物能够给巴西龟提供均衡的营养。食物种类包括饵料、水生植物、蔬菜、昆虫、鱼和虾等。除了这些食物外，还要额外的补充钙和维生素D3，钙质可以帮助硬化外壳和适应生长，维生素D3可以促进钙的吸收。同时与许多圈养动物一样，它们有过度喂养的可能，造成不必要和不可逆转的健康风险。
幼年巴西龟通常偏向肉食性，食肉意味着摄入更多的蛋白质，但随着它们越来越大，越来越老，它们会越趋向草食性。和人一样成年巴西龟随着年龄增加消化能力会减弱，所以幼年巴西龟的蛋白质摄入比例应该比成年巴西龟更多。如果条件允许的话，所有年龄段的巴西龟都可以喂活食或肉，但是不要喂食过多。成年巴西龟的主要饮食应包括商业生产的多种类型和品种的颗粒饵料，约占饮食结构的25%左右,适当添加无寄生虫的活食、深色绿叶蔬菜、水生植物以及胡萝卜和南瓜等切碎的蔬菜。应该避免吃那些会阻碍钙吸收的食物。例如，菠菜（含草酸），粉虫（钙磷比很低）。这两种物质都会干扰钙的吸收。少量食用不会对身体有害，但长期食用会影响龟壳和骨骼的发育。
巴西龟需要在水中才能吞咽，因为它们不会产生唾液。它们可能会把食物从陆地带到水中进食。此外，推荐用单独的容器喂养巴西龟，因为这样更容易保持容器的清洁，从而降低清洗和换水次数，方便喂养。
值得一提的是，巴西龟幼龟的饮食与成年巴西龟略为不同。所以不要简单了解喂养方法后就开始给巴西龟宝宝喂食。幼年巴西龟在出生后的头几个月里主要以肉食为主，所以如果你想让你的乌龟健康快乐地成长，你需要尽可能多地为小龟创造肉食性为主的饮食策略。你需要知道的是，小球饵料应该只占你的巴西龟宝宝饮食的5%，无论是颗粒的鱼食还是龟粮一般都含有大量的蛋白质，如果喂得过多，会导致乌龟超重，对健康不利。所以尽量少给你的龟宝宝喂食颗粒饵料。蔬菜应该占巴西龟宝宝饮食的25-30%。当你给他吃少量的深色绿叶蔬菜、胡萝卜或南瓜时，一定要把它们切碎。然后确保你捞起了所有它不吃的东西，这样就不会弄脏水或堵塞过滤器。肉类食物应该占到75%。在野外，幼年巴西龟吃昆虫、蠕虫、蜗牛、小蝌蚪和小鱼——基本上是它们能抓到的任何东西！在人工环境中，尽量用合适大小的粉虫、鲦鱼、蟋蟀和蚯蚓来模拟这个过程。应确保使用的是商业化培育的活食物，以免有寄生虫。
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