EM菌是有效微生物群(Effective Microorganisms)的英文缩写，由日本琉球大学的比嘉照教授于1982年研究成功，于20世纪80年代投入市场，很快在各大洲近90个国家得到推广应用，迄今为止，EM菌已在多个国家和地区使用，在农业、养殖、种植、环保等领域取得了明显的经济效益和生态效益。近年来，EM菌被广泛使用在养殖水体中用来改善养殖生态环境，目前水产养殖上使用的EM菌是以乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌、光合细菌等复配而成。鉴于EM菌培育对技术设备要求不高，因此在养殖户群体中可以进行简易扩培技术的推广应用。
1工具
塑料桶(有盖可密封，50～200升)、搅拌机(可用消毒木棍代替)、充气泵、敞口塑料桶。塑料桶、搅拌机及培养过程中使用到的所有容器工具均需清洗干净，经漂白粉消毒及阳光曝晒，保证干燥备用。
2培养用水
各地可根据各自的条件进行水源选择。可选择与养殖用水相同的海水水源，将养殖用水沉淀一天后，用50毫克/升的漂白粉消毒，3天后取上层水装于敞口塑料桶，用充气泵充分曝气，待余氯消除后即可用。也可使用曝气后的自来水或自然井水。
3所需培养基及药品
EM菌菌种原液、红糖或糖蜜(去硫)、酵母浸粉、微量元素、漂白粉。
4操作方法
以扩培50升菌液为例，在50升可密封塑料桶中盛20升培养用水，依次加入红糖或糖蜜1.25千克、酵母浸粉100克及微量元素50克，搅拌均匀后加入EM菌原液2.5升，然后加水至50升，再次搅拌均匀，密闭发酵。也可购买市场上出售的扩培套装，根据说明书的配比要求进行扩培。
培养时避免阳光曝晒，培养的最适温度为30～35℃，发酵周期4～5天，如气温低于20℃可适当延长密封时间2～3天再使用。发酵过程中会产生大量气体，可在培养2天左右时，开盖搅拌后再进行密封。
5质量控制
(1)看颜色：发酵后的菌液为类棕褐色，上层有一层白色菌膜，这是正常现象，这层菌膜多是好氧菌在表面接触氧气后生长繁殖起来的，菌一多聚集在液面上，就形成了一层菌膜。
(2)闻气味：气味为发酵酸甜味。
(3)测酸碱度：一般发酵成熟的EM菌其pH值在3.1～3.5，pH值越低，表面发酵过程中乳酸的产生量越高，发酵效果也越好。
(4)显微镜观察：有条件可以用显微镜进行形态观察和计数，质量好的菌液中活菌总数可达3×109cfu/毫升以上。
6保存
发酵成功后的菌液可直接用于养殖生产，常温下避光密封保存可保持活性6～12个月，一般推荐1个月内用完，活菌数会随着保存时间的延长而降低，养殖户可根据周期使用量控制单次发酵培养量，做到随用随培养，保证菌的最佳使用效果。
