(1) 施肥
养殖水体大都要施肥，施肥可促使藻类繁殖，改善水色。
施化肥的池塘，其水色由开始时的黄褐色逐渐转变为黄绿色，再转为嫩绿色，最后呈现蓝绿色。其原因是化肥的使用促进硅藻和绿藻的大量繁殖，使水体出现黄绿色；此后随环境变化硅藻和绿藻的优势地位让位给鞭毛藻，出现嫩绿色；最后蓝藻成为水体优势种群，水色转变为蓝绿色。
施有机肥的水体，水色由黑褐转为黄褐，再变为茶褐，最后呈现红褐；最初水体硅藻占优势，呈现黄褐色，当硅藻衰退，隐藻、硅藻、甲藻占优势时，呈茶褐色，之后裸藻及原生动物出现，而硅藻锐减，水色便变为红褐色。
同样道理，施牛粪的，水色为淡褐色；施猪粪的呈酱红色；施人粪的为深绿色；施鸡粪的为黄绿色。
施肥改变水色的根本原因在于水体的肥力状况决定了藻类的生长繁殖情况和水体的优势种群，并对藻类种群的演替方向施加潜在的影响。
(2 )加水
添换新水可延缓和防止水质老化，养殖水体可以通过更换一定量的新水来调节水质和水色。但实质上换水只是将污染转移到另外的地方，不能真正除去水体的多余有机质。
(3 )藻类接种
需要为水体营造某种水色时，可以定向接种某类或某些藻类，并添加一定的营养物质促使这些藻类大量快速生长，得到期望的水色。此外可以向水体接种适量的微生态制剂来调节水质，改变水体的营养状况，从而得到藻类种类及其应有的水色。
(4)抑制有害藻类
利用生存竞争规律来抑制某些有害生物生长繁殖，比如有害藻类蓝藻可以培育球藻等有益藻来抑制其暴发，也可通过种植水生植物使水体的水色得到较好控制。
