土壤有机质缺乏，菌肥的效果会受到严重的威胁！
为什么这么说呢？
我们都知道生物菌肥主要作用是其所添加的功能菌即有益微生物。这里所说的有益微生物，就是指那些能够活化根际土壤养分和产生根系促生物质、降解有机污染物和转化无机污染物形态以及抵抗土壤中病原微生物入侵根系等有益微生物。
这种肥料的第一个优势是，它进入土壤之后，能使土壤中那些现有的有利的微生物长得更快。
第二个优势也就是它的主要作用，它能把土壤中缺的那些好的有益的微生物，给补充上去，要知道
土壤有益生物缺乏，有害生物就会增多，作物根系和土壤就容易得病，抵抗力差，反之有益生物群增加就会消灭和转化有害菌。这就是增施生物菌肥的原因。
需要强调的是：微生物是活性的，使用微生物菌肥要想达到理想效果，必须要保证“这些生物菌进入土壤之后能不能存活”，这其实和我们人类生存生长是一个概念，都是要吃饭的，而微生物也是需要吃东西才能生存，只有生存下来它们才能够繁殖！
那么微生物的粮食是什么呢？
答案是：有机质，微生物进入土壤的主要粮食就是有机质。
但，问题是目前我们的大多土壤中的缺的就是有机质，试想如果在土壤有机质极度匮乏的地块中使用生物菌肥，那么它的肥效就很难保障！
所以，使用菌肥首先要考虑补充土壤有机质，同样，有机肥和菌肥搭配使用效果好的说法，也是这么来的。
1、微生物见*菌剂就死亡，生物菌肥不能与*菌剂混合使用。
2、微生物见紫外线就死亡，避免在中午紫外线强的时候使用，建议早上或者下午和阴天使用，使用后要立即覆土。
3、微生物菌肥都是有保质期的，一般最多为2年，越接近保质期菌的活性越难保证，建议购买使用时要特别注意这一点。使用生产日期越近越好。
4、菌肥是一种活性菌，施用时必须埋于土壤中，不能撒施于地表，一般深施7～10cm。由于生物菌对作物的根系和种子不造成任何伤害，所以菌肥施用时应最大限度地靠近作物根系，让其与作物根系最大限度地接触，才能充分发挥生物菌肥的肥效。
5、开袋后的菌肥如果当天没有用完，一定要注意100%密封保存，以免活性菌挥发影响再次使用效果。
切记，菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。土壤中有足够的有机物或腐殖质时才能被微生物菌利用，进而使土壤微生物快速繁衍，激活营养元素。微生物菌在土壤中作用主要是产生各种酶，分解各种养分，产生各种酸和二氧化碳，给作物提供更多养分。而微生物菌要成活和繁殖，土壤中要有足够的有机质才行。所以我们提倡有机肥和和菌肥搭配使用！
话说回来，土壤中的有机质充足，加强了土壤有益微生物的活动，从而最大限度促使有机物分解转化，产生多种营养物质和刺激性物质，反过来又刺激微生物的生长发育，促进作物生长，最终达到增产增收的目的。另外，功能性微生物在作物根系周围形成优势种群，抑制或拮抗有害病原菌的生长繁殖，减轻了作物发生病害的程度，进而起到减少作物病害发生增加产量的作用.
