这是F100发动机，在装备初期却有着高得惊人的故障，但被普-惠公司以“美国空军人员的个人意见不能代表美国空军的正式意见，这种质疑方式不符合常规程序”为由不予理睬。在一切争议都要以合同条文为依据的社会里，美国空军只好咽下半个苦果，提出对F100发动机故障多发问题造成的成本上升问题，由美国空军与普-惠公司经过谈判共同分摊。但是，普惠公司却坚持极为强硬的态度，坚持认为问题都是美国空军自己使用不当，
虽然美国空军与普惠公司历经多次谈判商议，普惠公司也拒绝分摊成本与责任。由于发动机频繁出现故障，F-15 大面积停飞，造成严重后果。在1978~1979 年间，出厂的 F-15 甚至长期没有安装发动机，而在停机坪上等待着F100-PW-100发动机问题解决。普-惠公司甚至利用配套配件厂的罢工事件，表示交付时间无法确定，来要挟美国空军就范给钱。在这种情况下，美国空军只有被迫停止接收F-15新机。。
最常出的故障是低压压气机叶片失速。压气机叶片在某些状态下会出现混乱紊流而导致叶片失速，直接影响到压气机与发动机运作的顺畅性和连贯性，造成发动机工作失常。而且这种停滞性失速是持续发生，飞行员必须将发动机关闭后重新启动，单发的F-16空中停车和重新启动时处在没有动力的状态，一旦空中启动不成功就将只有坠毁，
第二是F100-PW-100发动机的一级涡轮叶片常常仅使用很短时间就出现疲劳断裂破坏，当叶片发生断裂时，在每分钟3万转的高速下，断裂飞出的涡轮叶片犹如一把把飞刀，经常将后机身打得破烂不堪。这种故障是最危险的一种故障类型，一旦发生就将造成整台发动机失效，有时甚至会像爆炸一样对后机身造成严重损坏，导致飞机坠毁。
