可幸好的是秀芝不嫌许灵均是时代“反派”。
在她的人生信条里，好坏并非身份阶级决定的，所以秀芝依然跟许灵均成为伴侣，而在牧民们的帮助下，他俩还养起了鸡、鸭，不久后儿子清清诞生家庭更变得美好圆满。
听起来这个电影的情节确实是美好安逸。
祸乱时代不幸的许灵均遇到幸运的人，或善良的秀芝、或帮助他的老牧民，才让他得以活了下来，并在这无垠大草原过着惬意生活。
可实际上，《牧马人》这种美好里也却藏着不美好一面。
在改编《灵与肉》（《牧羊人》原小说）时，谢晋就引起过争议。
作为中国第三代导演代表人物、作为中国电影的民族魂、作为姜文的良师益友，谢晋作品里向来关注民族命运、关注时代变迁、关注时代下个体的挣扎，所以在他电影里，也有着强烈社会责任感和反思意识。
可这种意识在很多时候都是“反叛”的象征。由于谢晋作品总与时代保持同步，他亦喜欢以时代为背景讲述个人的喘息，而这也导致他的数部作品都有批判嫌疑。
其中最具代表性的当属《天云山传奇》跟《芙蓉镇》，尤其是在1981年的《天云山传奇》，当时改革开放不久，时代还未开始大规模平反，但谢晋却敢为天下先的在作品中表达了个人倾向。
于是这也造成，当年首届金鸡奖最佳电影评选中。
《天云山传奇》本以一票优势领先《巴山夜雨》，开始评委会决定两片并列最佳影片《天云山传奇》排名在前。可方案上报后《天云山传奇》却被排列在后，并因主题不符时代精神得到媒体一边倒抗议。
其后谢晋另一部电影《芙蓉镇》也曾遭到不公，作为姜文成名作，亦是不逊《活着》的伟大经典，《芙蓉镇》里由于有太多展现对时代的抗衡、对人性命运不公的挣扎呐喊。
从而也可导致影片被贴上“抹黑”社会的标签。《芙蓉镇》如此，《天云山传奇》如此、《牧马人》亦然。拍摄《牧马人》时，即使作为中国电影首屈一指大师，可当谢晋决定将《灵与肉》这部小说改编成《牧马人》时，依然遭到了很多人的抵制。
毕竟他反映时代变革的电影，在当时过于激进了。
可实际上《牧马人》无意控诉时代、无疑反抗什么，毕竟在原小说《灵与肉》中，作品批判跟控诉的风格就很平淡，而谢晋在改编时关于控诉跟反思更做了删减，更多挖掘作品积极向上的一面。
这方面通过影片倒序的开端便窥得一二。开头时候，许灵均父亲在女秘书陪同下回国旅游，并寻找失散多年的儿子许灵均，而当他想将许灵均带去美国时，却遭到了许灵均的拒绝。
当时的许灵均已经得到了时代的平反，并且成为了一名小学老师，而面对父亲对中国夹杂着偏见的调侃，他也表达了自己意见。
