实务中，我们经常听到两对概念：母公司与子公司、总公司与分公司。很多时候，大家可能会混淆，两对概念分辨不清，分公司当成子公司在处理。因此，今天就为大家介绍下这两对概念的区别，也帮助大家在注册新公司时做出正确的选择。
母公司与子公司母公司与子公司都是独立的法人主体，母公司与子公司都有自己的注册资本、公司章程，董事会等公司经营决策机构。其关系类似于父母与孩子的关系，虽然有血缘关系，但父母与孩子都是独立的个人，虽然父母会对孩子产生影响，但孩子具有自己独立的思维，可以独立做行为决策。
母公司与子公司均以自己的全部财产为限承担各自的责任，互不连带。母公司作为子公司最大的*，仅仅以其对子公司的出资额为限对子公司承担责任。
由于母公司与子公司是互相独立的法人主体，在税收方面，不管是增值税还是企业所得税，均应当独立核算。母子公司之间可以签订业务协议，互相开具发票。企业所得税方面，母子公司可以独立申请税收优惠，例如高新、加计扣除等，彼此之间的交易应当遵循独立交易原则。
总公司与分公司分公司是总公司的一部分，不具有独立的法人资格，没有注册资本，没有自己的独立财产，其实际占有、使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表，不独立承担民事责任。分公司也没有自己的公司章程，没有董事会等公司经营决策机构。在注册成立时，分公司也比一般公司的注册程序简单，不用核名，只要在总公司名称后加上分公司字样即可。总分公司的关系类似于我们的身体与四肢的关系，四肢是属于我们的身体，不能脱离身体独立行动。
总分公司在税收方面与母子公司有差异。增值税方面，总分公司之间也可以签订业务协议，互相开具发票，总分公司之间可以做不同的业务，分公司也可以承接总公司的业务，这一点与母子公司类似，差别不大。企业所得税方面，由于分公司不具有独立的法人资格，因此分公司的利润或者亏损需要汇总到总公司纳税，按照“统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算、财政调库”原则执行。
需要注意的是，很多企业认为自己的分公司是独立核算的，因此，企业所得税也是独立计算缴纳的，这一理解是不正确的。分支机构采用“独立核算”或者“非独立核算”，仅仅是企业内部管理的要求，而不是税务机关的要求，不影响总分公司汇总纳税的税务征管。
由于总分公司汇总计算企业所得税，因此，总分公司之间可以盈亏相抵，帮助企业达到降低税负的效果，这也是从企业架构角度进行税收筹划很重要的一种方式，而母子公司独立核算，不可以盈亏相抵。
了解母子公司、总分公司在企业责任承担、会计核算、税务处理等方面的差异，有助于帮助我们在注册新公司时全盘考虑，选择对自己更为有利的方式，从而提前进行筹划。
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