事业单位副高5级中人和正处级公务员退休后养老金有差别吗？差别肯定是存在的，即使同样是副高5级，或同样是公务员正处，其实养老金也是会有差别的。
机关事业单位工作人员从2014年10月1日开始缴纳养老保险以后，在2014年10月1日以后办理退休的机关事业单位退休人员，都属于退休中人，养老金都会按照缴费基数、缴费年限、个人账户余额、上年度职工月平均工资来综合计算。在养老金计算过程中，涉及到工龄的因素，职务职级的因素，专业技术职称的因素、退休时间的因素，退休地区的因素等。
事业单位副高5级，属于副高级技术职称最高的工资级别，但副高和正高之间仍然存在比较大的差别，从副高到正高还有一个艰苦的奋斗过程，即使到了副高5级，但要达到正高的难度也是很大的，这除了自己的专业技术能力以外，还有一个专业结构比例的问题，很多人终生能到副高5级已经算是功德圆满了。
与事业单位副高5级相比，正处级的公务员相对更为容易，越大的机关越有机会，特别是公务员实行职务职级并行管理制度以后，为公务员的晋升提供了新的通道，正处级的公务员可以是二级调研员，也可以是一级调研员。
由于机关事业单位工作人员养老保险的实际缴费年限比较短，特别是最近几年办理退休的机关事业单位中人，其共同的特征都是视同缴费年限大于实际缴费年限，很难完全按照实际缴费年限的缴费基数、缴费年限、个人账户来计算自己的养老金，但这也是一个基础。
缴费年限主要是看自己的工龄，工龄越长的养老金就会越高，事业单位副高5级的工龄，如果高于正处级公务员的，养老金可能会高于正处级公务员；相反如果正处级公务员的工龄高于副高级事业单位人员的，正处级公务员的养老金也会高于副高5级事业单位工作人员，工龄是缴费年限的组成部分。
缴费基数反应的是指数化缴费工资，指数化缴费工资折射的是平均缴费指数，平均缴费指数中，实际缴费指数是自己每月工资的体现，正处级公务员的工资待遇和副高5级专业技术人员是有差别的，这种差别主要体现在绩效部分，各种补贴部分，这些都是要计入缴费基数的。
视同缴费部分，主要考察的因素是职务、职级和专业技术职称，同样是正处级的公务员，二级调研员和一级调研员是不同的，还有任职的时间问题，有的人可能会担任正处级公务员10年到20年，有的人可能被聘任为副高的时间可能只有5年到10年，享受副高5级的工资待遇可能只有3年到5年，所以计算出来的平均视同缴费指数差别是比较大的。
过去机关事业单位工作人员退休，大家都讲究是按照什么级别退休，老制度按照级别退休，正处级公务员退休与副高5级退休，主要是看退休前本人的工资和工龄；养老保险制度实施以后，中人的养老金要按照新老办法对比计算，其中新办法计算的养老金中，主要是根据工龄和指数化视同缴费工资来评判了，视同指数化缴费工资，也就是自己职务、职级和技术职称、任职年限的综合反应。
综上所述，机关事业单位退休中人，副高5级和正处公务员相比，不能简单地对比谁的养老金会更高，要从任职年限、工龄、退休地区、退休年月来综合分析，才能得出比较正确的答案。
