经济普查针对一套表单位、非一套表单位、个体经营户和部门分别设置普查内容和普查表，采用全面登记、联网直报和手持电子终端设备等手段相结合、普查与抽样调查相结合的方式进行数据采集。
我国经济普查的业务流程主要包括普查区划分与绘图，单位比对，单位清查，普查告知，普查登记，数据审核、检查和验收，数据汇总，事后质量抽查和数据评估，主要数据发布和普查成果的开发与应用等阶段。
根据2018年修订的《全国经济普查条例》（国务院令第702号），经济普查按照“全国统一领导、部门分工协作、地方分级负责、各方共同参与”的原则组织实施。
国务院成立全国经济普查领导小组及其办公室，全国经济普查领导小组负责普查组织和实施中重大问题的研究和决策，普查领导小组办公室负责普查的具体组织实施和协调。地方各级人民政府设立相应的普查领导小组及其办公室，按照国务院经济普查领导小组及其办公室的统一规定和要求，具体组织实施当地的普查工作。
