26个分区
由于FAT16是单用户文件系统，不支持任何安全性及长文件名，微软公司决定实施新一代的FAT，称为FAT32，并通过Windows 95 OSR2发布。
Windows 95 (FAT32)
FAT32理论上运行磁盘容量达8TB，但由于微软公司磁盘扫描工具的限制，将容量限制在了124.55GB。后来Windows 2000和Windows XP格式化只能创建32GB的FAT32文件系统。
Windows NT
随着60GB、80GB、120GB的硬盘出现，FAT32的瓶颈就出现了，微软从Windows2000/ME（Windows NT）开始使用NTFS文件格式。由于主引导记录（MBR）分区表最大支持分区为2TB，如果要创建超过2TB的NTFS卷，就必须使用动态卷或GPT卷（64位系统UEFI才能引导GPT卷）。
电脑病毒和Ghost强化了分区的概念1987年巴基斯坦兄弟巴斯特（Basit）和阿姆捷特编写了第一个“个人电脑病毒”C-BRAIN，这个病毒会感染MS-DOS操作系统中的FAT格式磁盘引导扇区。只要有人盗拷软件，病毒就会发作将盗拷者的硬盘剩余空间给吃掉。这个病毒并没有太大的*伤力，但有心人以C-BRAIN为蓝图，制作出了各种各样的病毒变种。从此，新病毒纷纷出笼，各类扫毒、防毒与*毒软件也纷纷出现，重装系统变成了家常便饭一样的事情。
“熊猫烧香”感染的电脑
比如：
- 1998年CIH病毒可以篡改主板 BIOS，破坏系统全部信息。
- 2006年“熊猫烧香”病毒能够终止大量的反病毒软件和防火墙，并会删除扩展名为gho的文件，使用户无法使用ghost恢复操作系统。“熊猫烧香”感染系统以exe、com、pif、src、html、asp为后缀的文件，导致用户一开打这些文件，网页就会自动连接到指定病毒网址下载病毒，并在硬盘各个分区下生成文件autorun.inf和setup.exe。“熊猫烧香”还可以通过U盘和移动硬盘等进行传播，并利用Windows系统的自动播放功能来运行。“熊猫烧香”还可以修改注册表启动项，将被感染的文件图标变成“熊猫烧香”图案。“熊猫烧香”还可以通过共享文件夹、系统弱口令等多种方式进行传播。
- 2007年“网游大盗”是一款专门盗取网络游戏账号和密码的病毒。玩家电脑一旦中毒，就可能导致游戏账号、装备等丢失。
分区可以有效的隔离系统文件和用户文件，当电脑中病毒时，可以通过格式化系统盘，重装系统来快速的恢复生产力，然后进入系统后再来慢慢*毒。那时并没有PE启动U盘，也没有那么多丰富的软件，有一个软盘都是一件值得炫耀的事情，直到1998年左右才出现贵的离谱的只有十几MB的U盘。
