而最为困扰巴基鲸的问题则是运动问题。巴基鲸的四肢以及尾巴在陆地使用极其方便，但如果放到水里则是巨大的累赘。它身体的轮廓并不是完全的流线型，这导致它顶着水流的阻力游泳难度极大。
巴基鲸的身体导致它长时间游泳时所消耗的体力比其他水生动物要大，自然无法匀出其他体力用于捕食。
游动的巴基鲸
巴基鲸如何进化？为了能在水里生活，巴基鲸开始了一场痛苦而又漫长的进化历程。考古学家经考据证实，真正意义上的鲸鱼出现在4300万年前，这些鲸鱼就是进入海洋的巴基鲸后代。它们虽然体型还没有一匹马大，但是外形基本上变成了水生动物的样子。
为了减少能量的流失，曾经保暖的皮毛变成了厚厚的皮下脂肪。四肢以及尾巴的力量增强，游动速度比刚下水时更快了。而那些没有下水的巴基鲸，在时代的变迁过程中都消失了。
经过漫长的进化，鲸鱼终于完全适应了海洋的环境。体型庞大的鲸鱼在海洋“称王称霸”，几乎没有其他动物敢招惹它们。但是，鲸鱼却没有进化出鱼类特有的鱼鳃。
很多人认为鳃在水里的工作效率比肺更高，但其实这是个刻板印象。鲸鱼在数千万年的进化中，自然积累了无数的生存经验。如果鳃比肺的工作效率更高的话，它肯定会舍弃肺而用腮呼吸。
鲸鱼内部结构
鱼鳃的工作效率其实很低，鱼需要通过水吸入氧气以及排出二氧化碳。如果水体含氧量降低，则会直接影响鱼的生存。而鲸鱼却可以通过控制皮下脂肪的收缩，上浮到海平面上呼吸。
鲸鱼的肺也为了能在水下呼吸进行了一定的调整。大多数陆生哺乳动物的呼吸道与口鼻相连，这在水里极其容易呛水。完成进化的鲸鱼则使用头顶的喷水孔呼吸，通过它排出富含二氧化碳的海水，然后再吸入氧气。
