对于新兴的木化石来说，更是无法确切说清形成的原理，不用说实验室条件，目前对木化石的研究大部分都是表面性的观察性研究。现在的研究讲究实用性价值，在木化石并未被大多数人了解的前提下，其价值的局限不足以吸引大的研究机构的注意力。但这只是木化石目前的状态，至于将来说不定就像翡翠一样可以在实验室模拟生成环境和条件。
煤是层层植物遗体的堆积形成。在堆积过程中存在碳化过程，也就是局部氧化过程，并且在埋深过程中同样存在高压的环境条件。但是最主要一点，煤产生的地点没有木化石形成的环境条件。煤是高压状态下成岩作用，而木化石形成中二氧化硅溶液的交代是不可或缺的，煤层形成的环境应该不存在二氧化硅溶液的条件。煤的形成是硬性环境的固化作用，而木化石需要软化的二氧化硅溶液环境。
如果碳化的木质植物存在二氧化硅溶液包围的条件，也会形成木化石。这就是木化石的特殊类型，碳化木化石，马来西亚出产的木化石就有大量的碳化木化石。这类木化石大多数黑色到蓝黑色，质地类似于木化石“干料”，表面黑色，用手拂会有黑色颗粒沾在手上，但不是粉末状。
三、树化玉与玉的区别
第一，从外形看，它是段树木，它保持了树木所有的外形特征，它向人们所展示的树皮、树杈、树节、树结、木材纤维，无不保存了树木的原有形态。这种大自然流露出来的朴实、厚重、沧桑的外形是普通璞玉所没有的，璞玉向我们展示的往往只是圆滑、随意、鹅卵石或不规则石块般的外表。
第二，从剖面形状看，它首先是一段树木。它清晰完整地保持了树木原有的年轮、纹理、蛀洞，是古代树木内质形态的完整保留。通过显微镜，人们甚至还可发现树木韧皮组织形成的层细胞、细胞壁、输水导管的形状痕迹。而玉往往是一块排列整齐、结构极为单一的矿石。它虽然也有纹理，但这种纹理是自然产生的，具有很强的随意性，主要价值体现在供人欣赏。
第三，从色泽上看，由于树化玉的形成是一个原木质纤维、碳质被矿物质逐渐置换替代的过程，由于各个地区、各个历史时期置换替代的矿物质的差异造成了树化玉色彩的五彩缤纷，往往比普通玉石更加丰富。树化玉主要有白、灰、黄、褐、红、紫、绿、黑、蓝等颜色；而玉一般显示出的是白色向绿色过渡的各种颜色，一直到鲜艳夺目的翠绿。虽然也有其他颜色，如青灰、黄、红、黑，但数量较少，因此通常一提到玉，我们首先想到的便是绿色或白色。
第四，从资源上看，二者虽然都是稀有矿藏，但树化玉的妙处在于，每棵树化玉的形态、色泽、内质、纹理千姿百态，变幻莫测。要找到二棵色泽、纹理、形状、种水、大小相近的树化玉，简直就像大海里捞针。就是把同一棵树化玉锯成几段，其树理、色泽、形状仍是各有千秋。因此，你所喜欢的树化玉往往就是一块可遇不可求的人间绝品。而人们却可容易地找到两颗甚至一批相近或相似的玉石翡翠。
第五，从用途上看，首先，树化玉是大自然形成的植物化石，是一部研究远古气象、其他生物和地理资料的书籍，有着珍贵的考古和科研价值。其次，在工艺上树化玉不仅可以制作雕饰、挂件、摆件等小型装饰品，还可制作大型雕件。最可贵的是它的奇特，人们往往不加修饰直接将它作为庭院的点缀，或者作为吉祥安宁的象征供在家中作为镇宅之宝石。而玉石很少有科考价值，一般只能雕琢成小摆件、首饰、挂件等小件装饰品。人们在欣赏它漂亮质地的同时，主要是欣赏它的雕琢工艺。
四、树化玉的价值
从树化玉中显示出的年轮、纹理以及变化万千的色彩和它流露出来的天然神韵，让人爱不释手，如痴如醉。同时美丽的年轮和树皮的沧桑记录着远去的那个年代的若干信息。树化玉记录着远去的地质时代丰富的地理和气象信息，有着不可估量的历史科研价值和收藏价值。树化玉不但有很高的经济价值，而且具有很高的观赏价值和科考价值。
科研价值：树化玉不同于其他的一些宝石，它首先是一块化石，是远古树木石化的残体。从树化玉向我们提供的年轮、枝杈、纹理、虫洞、树壳以及各种树化玉分布地区的地质构造和地层的状况，可以获得大量当地远古时期气象资料和植物群落组合、地域间变化关系、经纬度变化关系、地史变化、地壳运动等一些规律。它是一本极其珍贵的远古地理、气候、历史书籍，向我们提供了很多极为重要的远古信息。通过对其综合分析，能够不断完善人类本身对生存环境的认识，促进人类社会的发展，促使人类与大自然进一步和谐共存。
