接口方面，也是VAIO S13的一大亮点，机身左侧包括电源、锁孔、2个USB 3.0、耳麦一体接孔，机身右侧为SD卡插槽、1个支持关机充电的USB3.0、HDMI、LAN端口以及VGA接口。保留VGA接口使得S13有着更加广泛的通用性，加上HDMI可实现同时接驳2个外置屏幕实现3屏显示，3个USB3.0也能够应付绝大多数扩展需要，从接口数量、种类而言，S13考虑地非常周全。
VAIO S13的D面并未设计有散热孔，散热进风被设计在了屏轴处。
得益于六棱贝设计，S13和S11屏轴处的进风孔并未紧贴屏幕底部，而是呈一定角度，基本处于半开放状态，再加上进风孔几乎贯穿整个屏轴位置，使得S13的散热有所保证。
