正如前文所述，这种状况持续到了80年代末期。由于市场上类似的作品趋于饱和，而对机甲真实性的过度追求也开始逐渐影响到了硬科幻机甲类作品的创新性，类似《阿拉蕾》和《多啦A梦》这样主题更为轻盈的机器人动画开始大行其道，而仍坚守机甲动画的创作者们也开始在作品中加入越来越丰富的美少女元素，超能力元素和类似龙与地下城的奇幻冒险元素。
后者的优秀代表便是诞生于1988年的《魔神英雄传》，但国内引进后更习惯将其翻译成《神龙斗士》；
而至于前者，在经历了多年没有优秀代表作的尴尬后，庵野秀明和他的《新世纪福音战士》横空出世，一方面作为美少女 超能力 真实系机甲动画的集大成者，展现了一个介于科幻与魔幻之间——其实主要还是科幻，但其展现出的技术完全不够科学的未来世界；另一方面也作为另辟蹊径者，将故事的重心由惊险刺激的机甲互殴和正邪对抗转向了对几位主角内心世界之复杂性和矛盾性的刻画与展现。
由此全世界第一次体验到了三无少女和傲娇少女的独特魅力，此前或神通广大或苦大仇深的女性机甲驾驶员也终于有了人见人爱的少女感，因此就算《新世纪福音战士》在千禧年后逐渐失掉了自己的影响力，这种在机甲和少女中关注后者的独特叙事依然能够被后来者们竞相模仿，成为了机甲少女动画的一大标准。
这倒不是说市场否定了庵野秀明的天才之作，只是随着日本生育率持续走低，电子游戏行业异军突起，玩具行业整体陷入低迷，导致机器人动画整体陷入了颓势。
而似乎可以被看成是各大厂商面对这种颓势的应对策略，新世纪的机器人动画将目标观众由此前的少年儿童重新定位成了有一定消费能力的宅家青年和有机甲情节的中年观众，因此动画的尺度也得以进一步增加，机甲少女们反而在争议声中迎来了自己的黄金时代：
她们身怀绝技，她们面容娇好，她们有一般少女的小心思，也像一般少女那样有着可爱的日常生活，也会“大局为重”，羞涩地与主角情投意合，以此激活机甲的最强形态……疏离感与亲近感就这样又一次达到了完美的平衡。
别误会，这里绝没有暗示新机甲动画不务正业大搞擦边球的意思。事实上，在经历过几十年的发展之后，那些疑似擦边球的机甲少女动画同样也都有着可圈可点的故事发展和足够撑起故事设定的逻辑性，否则刻意而单薄的机甲少女本身也没什么魅力可言嘛不是？
那么在新千年的诸多机甲少女中，给你留下最深印象的又是哪一位呢？欢迎各位在评论区畅所欲言，分享你的故事。
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