一行人再次回到蜀山，却发现邪剑仙偷走了雪见的肉身。众人在冰风谷入口处发现邪剑仙准备对雪见的肉身施法，于是一场较量，此时重楼再次现身帮助众人击退邪剑仙。
这时长卿让众人到剑冢帮忙，去阻止邪剑仙打造武器。邪剑仙用魔剑和镇妖剑打造出一把超级武器然后刺入景天的胸口。
这时虐心的剧情出现了，玩家需要选择牺牲一个人来复活景天，如果选择镇妖剑要牺牲龙葵，如果选择魔剑要牺牲雪见（仙剑通用虐心套路）。
复活后的景天跟众人一起终于消灭了邪剑仙。这时的锁妖塔开始崩塌，因为还没有找到水灵珠无法修补。就在众人束手无策之时，紫萱上前施法，原来水灵珠在她的体内。紫萱将自己的修为传给了长卿，然后准备以生命为代价重新封印锁妖塔。
这时如果景天跟紫萱好感度高，会进入到紫萱结局。此时重楼出现，救下紫萱，并用魔力修复锁妖塔。得到修为的长卿成为了蜀山掌门。
在其他结局中，紫萱都会牺牲，景天上前阻止重楼跟长卿的对决，并抓住雪见。此时景天跟重楼对决。如果战斗失败且选择牺牲龙葵会进入雪见结局。景天寻找落入人间的雪见，两人最终在当初约定的竹林再次相遇。
如果战斗失败且选择牺牲雪见会进入龙葵结局，龙葵体内的红葵人格脱离，回到现实，龙葵跑向景天，两人在一起。
如果跟花楹好感度较高会进入到花楹结局，景天会独自一人离开蜀山，并且选择跟花楹在一起。
还有一个完美结局，那就是击败重楼，而且雪见或龙葵的好感度高于花楹和紫萱，这时的景天有了自己的当铺，当上了老板，雪见成了老板娘。龙葵也留在景天身边，这无疑是最好的结局。以上就是仙剑3的主线剧情内容。
话说后来才知道仙剑3里面的角色名称都是中草药。游戏制作组取名字的时候真的有心了。话说你还记得仙剑3的所有结局你都打出来过吗？欢迎留言。
