此外光荣在本作中非常注重对CG和立绘的使用，使整部作品的叙事部分看起来就像是一款文字AVG，这样设计虽然有些取巧的嫌疑，但事实证明2D绘画的表现力确实比当时还很粗糙的3D动画要好得多，相比系列以往作品所采用的真实系风格，《大航海时代4》的美术风格自成一派，结合了日式漫画和西方油画元素，尤其在人设方面，几乎是清一色的帅哥美女颇为养眼，颠覆了人们对那个时代航海家的固有粗犷印象。
负责本作人设和CG绘制工作的原画师名叫“宇野道夫”，他对利用西式风格来展现东方古典美的技法颇为拿手，不仅在《大航海时代4》中创造了让无数中国玩家魂牵梦绕的李华梅，还曾为金庸的武侠小说日文版绘制插画，其笔下的郭靖、黄蓉等武侠人物也颇具神韵，有趣的是，对中国文化很有兴趣的宇野道夫，后来研究起了少林拳、八卦掌、太极拳，最终成为了一名武术大师，还创立了一家名叫“极峰”的拳社。
《大航海时代》系列以战斗、交易、冒险为三大核心要素，四代的战斗系统改为了即时制，玩家在海上遇敌后便会直接进入战斗状态，但除了移动速度会变慢之外，船只的操作以及船帆管理与平时的正常航行没有太大区别，在没有加装船头和船尾炮的前提下，当敌人的舰队处于玩家侧面时，船只便会自动展开炮击，因此在进行炮战时要尽量采用“T字战法”，除了炮战外，敌我船只零距离接触时还会自动展开白刃战，更有一定概率会触发特殊战斗，例如单挑、甲板战、舱式战、狙击、撞击，通过白刃战取得战斗胜利时，可以得到比炮战更加丰厚的资金和货物，此外还有一定概率俘获敌人留下的船只和水手，白刃战可以说是一个风险与收益并存的战斗方式。
交易系统历来都是《大航海时代》系列的重要组成部分，四代的大部分港口都设置有交易所，玩家只需在总督或国王处签订契约并取得一定的占有率，便可以进入交易所做生意，交易所出售交易品的种类和数量与该港口的发展度和玩家的占有率息息相关，本作比以往更完善的地方在于价格波动更加真实，可以在一定程度上反映当前地区的市场状况，如果玩家在同一地区的两座港口大量倒卖同类交易品，那么便会造成两种交易品的价格在短时间内双双*。
