在宇田钢之介的带领下，《航海王》TV版动画在前期保持了良好的势头，并得到了观众的广泛认可。其中，就像上文提到的那样，原作者本人对作品的演出非常看重，而这恰恰是《航海王》动画最大的优势之一。贝尔梅尔和希鲁鲁克的牺牲以及绽放于冬季的樱花让无数观众为之落泪，与克洛克达尔进行最终决战时奏响的《自新世界》让无数观众汹涌澎湃，而响彻天空的钟声又令无数观众感受到了何为男人的浪漫……
在TV版动画开播5个月后，《航海王》的首部剧场版也于2000年3月4日公映。此后一直到2009年，《航海王》剧场版以每年一部的节奏与观众见面。
《航海王》前三部剧场版均为一个小时左右的中篇作品，并与《数码宝贝》系列的短篇剧场版动画共同上映。其中，第一部作品《航海王剧场版》和第二部作品《发条岛的冒险》还获得了第18、19届金光奖（ゴールデングロス賞）银奖。
而在2003年3月1日，由宇田钢之介亲自执导的《死亡尽头的冒险》上映，这也是《航海王》的首部长篇剧场版。由于本作是首部片长达到90分钟以上且独立上映的作品，《死亡尽头的冒险》的制作思路和前三作有着很大的区别。例如，宇田钢之介曾提到，本作相对于以往更加重视成人观众的观影体验。而为了能够吸引此前没有看过《航海王》的观众也能够充分欣赏本作，宇田钢之介在世界观以及登场角色的介绍方面也画了较多心思。本作冒险风格浓厚，被誉为是一部“海贼味”浓厚的作品，一经上映便取得了优秀的口碑。
二
在为期三个月的高质量原创篇章G8要塞篇后，《航海王》TV版动画从2004年10月31日播出的第207话开始采用16:9高清化制作，并成为了富士电视台首部采用高清化制作的动画作品。
注: 《航海王》TV版动画从207话开始采用高清化制作
在数字电视尚未完全普及的2004年率先采用高清化制作，这足以说明《航海王》动画的受重视程度，以及这部作品所受到的期待。然而，《航海王》动画在当时正面临着一系列的隐忧，并且这些隐忧在随后就接二连三地浮出水面，使《航海王》动画一度遭遇到生死存亡的危机。
继前一年度的《被诅咒的圣剑》之后，由细田守执导，并带有浓厚的细田守个人风格的《狂欢男爵与神秘岛》于2005年春季上映。然而，虽然本作有着很高的艺术价值，但是由于基调过于黑暗、压抑，且故事以及作画风格与《航海王》的主基调有着较大的不同，本作在上映后出现了口碑严重两极分化的状况。不仅如此，本作上映之前的宣传语“史上最大的滑稽戏”与作品的黑暗风格大相径庭，也进一步加剧了本作所遇到的争议。最终，《狂欢男爵与神秘岛》仅获得了12亿日元的总票房收入。
