第二点影响周杰伦和吴宗宪关系的就是音乐版权纷争。
当初吴宗宪把音乐公司卖给了另外一家公司，而周杰伦和方文山也一起被“转”给了新公司。
曾经在吴宗宪的公司帮忙周杰伦处理唱片事务的杨峻荣也跟着跳槽去了新公司。
后来，杨峻荣再次离职，并和周杰伦以及方文山一起创立了杰威尔音乐有限公司。
从歌手变为老板之后，周杰伦和前东家不可避免地产生了音乐版权纷争。
前东家认为，他们理应拥有周杰伦此前发表过的专辑的音乐著作权。
但事实是，周杰伦和吴宗宪签经纪合约时，额外补充了一条款项，那就是等周杰伦的经纪合约到期时，周杰伦便会收回自己所有歌曲的全部音乐著作权。
也就是说，2007年周杰伦和公司的经纪合约结束时，他全部歌曲的著作权自然就不属于前东家了。
可是，和周杰伦签约的是吴宗宪，但最终为此买单的却是现在的公司。
现任老板当然不会心甘情愿地接受，所以，他们以公司的名义申请冻结周杰伦的资产。
按道理来讲，这件事情似乎和吴宗宪没有关系，但如果吴宗宪卖公司的时候能把这些事情都交接清楚，周杰伦和前东家也许就不会闹出音乐版权之争了。
所以，在这起纷争中，吴宗宪看似是旁观者，但其实他是一切矛盾的源头。
经此一事，周杰伦和吴宗宪的关系自然就进一步恶化了。
