贪婪的士绅地主阶级
最终孙传庭以一己之力对抗利益阶层，用武力抄没家财充公才得以出关平叛，不管是胜还是败，他的结局都是死无葬身之地。因为他与士绅官僚阶级形成了敌对关系。他出征的时候，或许已经知道大明无药可医了。
孙传庭是*伐果断的大将，影片也并没有将其塑造成完人。演员戴立忍将其喜怒哀乐塑造的非常生动，既有对家人的关爱，也有在军中严刑峻法的冷酷，为了目的用尽手段，把位高权重的大将威严展现的淋漓尽致。对应的另一位主角吴又可，在演员冯远征的演绎下，神形都非常像草根的市井百姓，外貌言语经过几段镜头的表达，就把一个直爽、富有同情心的游医，描绘的非常地道鲜活。
吴又可军中防疫救灾
吴又可在行医过程中，看到太多尸位素餐的医者，不甘在太医院同流合污，宁愿风餐露宿做个游医。在中原大地上看到太多因为瘟疫导致家破人亡的惨剧，吴又可一直在探索防疫救助的方法。在古代中国，第一个提出了瘟疫是通过空气传播，并通过口鼻侵入人体的观念，并著有《瘟疫论》，为后世治瘟带来巨大贡献。
吴又可与恩师在医道出现分歧
医生，行走于乱世，即使有着天纵之才，秉持救世济民的理念，也很难有所作为，甚至保命都成了难题。但吴又可不仅大胆异于常规，寻求瘟疫的有效治理之术，还著书立作传于后人，其人格魅力在影片中得以彰显。在历史事实中，吴又可不服从清廷的「剃发令」而被处决，其结局是让人难以释怀的悲剧。毫无疑问他是明末铁骨铮铮的好医士。
吴又可佩戴口罩防疫
电影从头至尾始终笼罩在一种无力徒劳的氛围中，纵然有孙传庭、吴又可这样的人杰，还有无数苟且之辈在拼命试图吸干最后一滴血。在大厦将倾之时，没有人拥有力挽狂澜的能力。他们只是在巨浪之中摇曳的小舟，既救不了他人，也救不了自己。在最后，把主角们最终的结局通过文字进行了陈述，均没有得到善终，将无力感持续到影片最后……
