第二代————艾吉奥·奥迪托雷·达·佛罗伦萨
可以说是人物背景最丰富的一位刺客大师，以艾吉奥为主角一共发布了3部系列作，也就是熟知的《刺客信条：三部曲》，贯穿了这位刺客大师的一生。所以是玩家们印象里最深刻的一位刺客大师，（个人认为服装设计也是最优雅的一代）。
艾吉奥·奥迪托雷是《刺客信条》系列前期现代故事线主角戴斯蒙德·迈尔斯的父系祖先，后者通过名为Animus的机器提取自身DNA中潜藏的先祖记忆，借此体验艾吉奥的生活。
艾吉奥于1459年出生在意大利城市佛罗伦萨的贵族家庭，是奥迪托雷（Auditore）家族的一员。他在17岁前一直过着无忧无虑的富裕生活，又经父亲乔瓦尼（Giovanni）介绍给银行家乔瓦尼·托尔纳博尼当过学徒。
但情况在乔瓦尼发现针对佛罗伦萨统治者洛伦佐·德·美第奇的暗*阴谋后急转直下：他指控弗朗切斯科·德·帕齐参与其中，并将收集的证据转交正义旗手乌贝托·阿尔贝蒂（Uberto Alberti），殊不知后者也是帕齐的同谋。乌贝托反而诬陷奥迪托雷家族策划了这场阴谋，逮捕绞死了家族全体男性成员。
彼时艾吉奥在外帮父亲跑腿而躲过一劫，于是继承父亲遗志与刺客衣钵，携母亲和妹妹逃往叔叔马里奥（Mario）所在的家族庄园蒙特里久尼。
在蒙特里久尼，马里奥协助艾吉奥调查阴谋的主使，同时训练他的战斗技能。正当艾吉奥执行着对帕齐家族的复仇计划，却发现更多佛罗伦萨之外的人牵涉其中。接下来的十年里，艾吉奥致力于追踪和消灭各路阴谋参与者，辗转佛罗伦萨、圣吉米尼亚诺和弗利，最后来到威尼斯。
此间他也结识了尼科洛·马基雅维利、卡特琳娜·斯福尔扎和列奥纳多·达·芬奇（老重要了：武器商[看]）等诸多友人：部分得益于他们的引导，艾吉奥没有被复仇的怒火吞噬，转而踏上了寻求正义的救赎之路。
最终艾吉奥了解到，阴谋的始作俑者正是领导意大利圣殿骑士组织的罗德里哥·波吉亚，后者此番意欲找寻上古神器伊甸碎片（Pieces of Eden）之一、能够控制人类心智的伊甸苹果（Apple of Eden）。1488年，艾吉奥于威尼斯截获携伊甸苹果归来的波吉亚，后者则在对峙中自命为有权开启传说中密室（Vault）的先知（the Prophet）。艾吉奥的友人们随即赶到，与其合力击败波吉亚并夺下伊甸苹果，又告知艾吉奥他们都是刺客的真相。艾吉奥方才明白先知就是自己，于是正式加入刺客兄弟会。
不久后艾吉奥护送伊甸苹果前往弗利，恰逢波吉亚为夺取阿泰尔·伊本·拉阿哈德所写有关伊甸苹果的手札而雇佣的军队攻城。艾吉奥在击退来犯者时遇袭受伤，伊甸苹果也被一名路过的修士捡走。
康复后的艾吉奥得知此人名叫吉罗拉莫·萨佛纳罗拉，便启程追寻。1491年，艾吉奥听闻波吉亚对克里斯托弗·哥伦布探索新大陆的计划深感兴趣，于是潜入哥伦布与圣殿骑士在威尼斯的会面，意外解救了落入后者圈套的哥伦布。
与哥伦布同行的路易斯·德·圣坦杰尔告诉他，托马斯·德·托尔克马达领导的西班牙宗教裁判所正四处搜捕刺客兄弟会成员，艾吉奥遂远赴西班牙营救。在西班牙，艾吉奥挫败了宗教裁判所于巴塞罗那和萨拉戈萨的行动，并救出被圣殿骑士软禁以延长战争的格拉纳达国王穆罕默德十二世。
最终路易斯成功说服伊莎贝拉女王资助哥伦布的探险，艾吉奥也在完成使命后回到意大利。
1497年，艾吉奥回到家乡，发现萨佛纳罗拉已在利用伊甸苹果蛊惑市民赶走美第奇家族后接管佛罗伦萨，并下令大规模焚毁艺术品和书籍。
艾吉奥于是趁乱刺*萨佛纳罗拉及其追随者，拿回伊甸苹果的同时终结了后者的严苛统治。到了1499年，艾吉奥和友人们终于集齐阿泰尔的手札，获悉密室就位于罗马西斯廷小堂地下。彼时波吉亚已于1492年成为教皇，其手握的权杖便是另一块伊甸碎片，与伊甸苹果结合即可开启密室。
在友人协助下，艾吉奥成功潜入梵蒂冈并试图刺*教皇，却与权杖力量加身的波吉亚陷入苦战，伊甸苹果也被其抢走。但波吉亚很快发现自己打不开密室，随即被追来的艾吉奥击倒。意识到*死波吉亚也无法使家人复生，艾吉奥最终决定饶他一命。而当艾吉奥进入密室后，一个全息投影人物出现在他面前：其人自称密涅瓦，来自创造了人类和伊甸碎片的先进文明。确认过艾吉奥先知的身份，密涅瓦转而告知正在使用Animus的戴斯蒙德一场耀斑灾难即将降临，催他赶紧行动。投影至此消失，徒留艾吉奥迷惑于戴斯蒙德究竟是谁。（以上是《刺客信条II》的剧情）
《刺客信条：兄弟会》剧情承接《刺客信条II》，艾吉奥结束梵蒂冈之行回到蒙特里焦尼，很快遭同为圣殿骑士的罗德里哥·波吉亚之子切萨雷·波吉亚以教皇名义率军攻城。随着蒙特里焦尼沦陷，切萨雷取得伊甸苹果，卡特琳娜·斯福尔扎被抓，叔叔马里奥遇害，负伤的艾吉奥护送母亲和妹妹逃离庄园，便独自赶往波吉亚家族的统治中心罗马，却因体力不支半道落马。
幸得尼科洛·马基雅维利救助，艾吉奥成功抵达，不久伤愈。彼时波吉亚治下的罗马百姓苦不堪言，二人因此计划发动群众解放罗马，推翻波吉亚家族并取回伊甸苹果。艾吉奥遂以市内台伯岛为刺客兄弟会总部，联合妓女、盗贼和佣兵等团体，不断壮大刺客势力。期间他帮助尼古拉·哥白尼躲避圣殿骑士追*，救出关押在圣天使堡的卡特琳娜，摧毁达·芬奇被迫制造的各式战争机器，并开始招募大批平民加入兄弟会。
