巴东郡于汉献帝初平六年(公元195年),由当时的益州牧刘璋分巴郡设置,当时叫固陵郡,建安六年(公元201)更名巴东郡。西晋时期下辖三个县,鱼复、朐䏰和南浦,户六千五百。
和巴东郡一同被设置的是巴西郡,西晋时期巴西郡下辖九个县,分别是阆中、西充国、苍溪、岐惬、南充国、汉昌、宕渠、 安汉和平州,户一万二千。
由于蜀汉在蜀中经营多年,所以很多郡的设置和他们有关。建安二十二年(公元217年),刘备拆分广汉郡设置梓潼郡,西晋时期下辖八个县,分别是梓潼、涪城、武连、黄安、汉德、晋寿、剑阁和白水,户一万二百。
涪陵郡最早于建安六年(公元201年)由刘璋分巴郡设置巴东属国,随后于建安二十一年(公元216年),刘备改巴东属国为涪陵郡。西晋时期下辖五个县,汉复、涪陵、汉平、汉葭、万宁,户四千二百。